Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GOLGA6BA6NDN3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GOLGA6BA6NDN3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GOLGA6BA6NDN3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GOLGA6BA6NDN3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GOLGA6BA6NDN3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 322.9 ms