Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VPS37CA5D8V6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
VPS37CA5D8V6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VPS37CA5D8V6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VPS37CA5D8V6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VPS37CA5D8V6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms