Protein–RNA interactions for Protein: A4D161

FAM221A, Protein FAM221A, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM221AA4D161 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM221AA4D161 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM221AA4D161 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM221AA4D161 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM221AA4D161 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms