Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PIPSLA2A3N6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PIPSLA2A3N6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIPSLA2A3N6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PIPSLA2A3N6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms