Protein–RNA interactions for Protein: A1A4F0

PQLC2L, Putative uncharacterized protein PQLC2L, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2LA1A4F0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PQLC2LA1A4F0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PQLC2LA1A4F0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PQLC2LA1A4F0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms