Protein–RNA interactions for Protein: A0AVI4

TMEM129, E3 ubiquitin-protein ligase TM129, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM129A0AVI4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM129A0AVI4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM129A0AVI4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TMEM129A0AVI4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM129A0AVI4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms