Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GTW7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GTW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A1B0GTW7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A1B0GTW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A1B0GTW7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A1B0GTW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms