Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
A0A0J9YYE9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A0J9YYE9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A0J9YYE9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
A0A0J9YYE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
A0A0J9YYE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms