RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640484.1

SZT2-217, Transcript of SZT2, KICSTOR complex subunit, humanhuman

TSL 5

Gene SZT2, Length 2,266 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2-217ENST00000640484 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.31■■■□□ 2.6
SZT2-217ENST00000640484 HRCP23327 699 aa27.65■■■□□ 2.02
SZT2-217ENST00000640484 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.32■■□□□ 1.96
SZT2-217ENST00000640484 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.99■■□□□ 1.91
SZT2-217ENST00000640484 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.99■■□□□ 1.91
SZT2-217ENST00000640484 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
SZT2-217ENST00000640484 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
SZT2-217ENST00000640484 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.83■■□□□ 1.89
SZT2-217ENST00000640484 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
SZT2-217ENST00000640484 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.73■■□□□ 1.87
SZT2-217ENST00000640484 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.68■■□□□ 1.86
SZT2-217ENST00000640484 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
SZT2-217ENST00000640484 ABCC9O60706 1549 aa26.4■■□□□ 1.82
SZT2-217ENST00000640484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.25■■□□□ 1.79
SZT2-217ENST00000640484 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SZT2-217ENST00000640484 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
SZT2-217ENST00000640484 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SZT2-217ENST00000640484 MYT1Q01538 1121 aa25.94■■□□□ 1.74
SZT2-217ENST00000640484 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.89■■□□□ 1.74
SZT2-217ENST00000640484 NACADO15069 1562 aa25.51■■□□□ 1.67
SZT2-217ENST00000640484 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
SZT2-217ENST00000640484 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.41■■□□□ 1.66
SZT2-217ENST00000640484 SCRIBQ14160 1630 aa25.35■■□□□ 1.65
SZT2-217ENST00000640484 NEUROD1Q13562 356 aa25.33■■□□□ 1.64
SZT2-217ENST00000640484 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
SZT2-217ENST00000640484 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.18■■□□□ 1.62
SZT2-217ENST00000640484 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.12■■□□□ 1.61
SZT2-217ENST00000640484 TRIM41Q8WV44 630 aa25.01■■□□□ 1.59
SZT2-217ENST00000640484 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
SZT2-217ENST00000640484 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
SZT2-217ENST00000640484 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SZT2-217ENST00000640484 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SZT2-217ENST00000640484 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SZT2-217ENST00000640484 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.8■■□□□ 1.56
SZT2-217ENST00000640484 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SZT2-217ENST00000640484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
SZT2-217ENST00000640484 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
SZT2-217ENST00000640484 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.53■■□□□ 1.52
SZT2-217ENST00000640484 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.47■■□□□ 1.51
SZT2-217ENST00000640484 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
SZT2-217ENST00000640484 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
SZT2-217ENST00000640484 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
SZT2-217ENST00000640484 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.31■■□□□ 1.48
SZT2-217ENST00000640484 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.3■■□□□ 1.48
SZT2-217ENST00000640484 MIER1Q8N108 512 aa24.29■■□□□ 1.48
SZT2-217ENST00000640484 CEP162Q5TB80 1403 aa24.22■■□□□ 1.47
SZT2-217ENST00000640484 SMARCA4P51532 1647 aa24.16■■□□□ 1.46
SZT2-217ENST00000640484 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SZT2-217ENST00000640484 WIZO95785 1651 aa24.14■■□□□ 1.45
SZT2-217ENST00000640484 TNIKQ9UKE5 1360 aa24.11■■□□□ 1.45
SZT2-217ENST00000640484 ANP32EQ9BTT0 268 aa24.08■■□□□ 1.44
SZT2-217ENST00000640484 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SZT2-217ENST00000640484 BCL11AQ9H165 835 aa23.99■■□□□ 1.43
SZT2-217ENST00000640484 EEA1Q15075 1411 aa23.96■■□□□ 1.43
SZT2-217ENST00000640484 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.95■■□□□ 1.43
SZT2-217ENST00000640484 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.95■■□□□ 1.42
SZT2-217ENST00000640484 ABCC8Q09428 1581 aa23.91■■□□□ 1.42
SZT2-217ENST00000640484 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.83■■□□□ 1.4
SZT2-217ENST00000640484 GOLGA3Q08378 1498 aa23.82■■□□□ 1.4
SZT2-217ENST00000640484 SOGA1O94964 1423 aa23.82■■□□□ 1.4
SZT2-217ENST00000640484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.81■■□□□ 1.4
SZT2-217ENST00000640484 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
SZT2-217ENST00000640484 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.75■■□□□ 1.39
SZT2-217ENST00000640484 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
SZT2-217ENST00000640484 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.72■■□□□ 1.39
SZT2-217ENST00000640484 SMARCA2P51531 1590 aa23.7■■□□□ 1.38
SZT2-217ENST00000640484 DNAJC5BQ9UF47 199 aa23.68■■□□□ 1.38
SZT2-217ENST00000640484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
SZT2-217ENST00000640484 KIF21BO75037 1637 aa23.67■■□□□ 1.38
SZT2-217ENST00000640484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.66■■□□□ 1.38
SZT2-217ENST00000640484 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SZT2-217ENST00000640484 VPS8Q8N3P4 1428 aa23.61■■□□□ 1.37
SZT2-217ENST00000640484 NCAPD3P42695 1498 aa23.58■■□□□ 1.37
SZT2-217ENST00000640484 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.58■■□□□ 1.37
SZT2-217ENST00000640484 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SZT2-217ENST00000640484 CLIP1P30622 1438 aa23.55■■□□□ 1.36
SZT2-217ENST00000640484 HMGXB3Q12766 1538 aa23.5■■□□□ 1.35
SZT2-217ENST00000640484 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SZT2-217ENST00000640484 CUX2O14529 1486 aa23.36■■□□□ 1.33
SZT2-217ENST00000640484 APLP2Q06481 763 aa23.36■■□□□ 1.33
SZT2-217ENST00000640484 FKBP8Q14318 412 aa23.3■■□□□ 1.32
SZT2-217ENST00000640484 SYNJ1O43426 1573 aa23.29■■□□□ 1.32
SZT2-217ENST00000640484 BCANQ96GW7 911 aa23.28■■□□□ 1.32
SZT2-217ENST00000640484 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SZT2-217ENST00000640484 KCNH8Q96L42 1107 aa23.24■■□□□ 1.31
SZT2-217ENST00000640484 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.22■■□□□ 1.31
SZT2-217ENST00000640484 NEFLP07196 543 aa23.19■■□□□ 1.3
SZT2-217ENST00000640484 MSH5O43196 834 aa23.15■■□□□ 1.3
SZT2-217ENST00000640484 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.14■■□□□ 1.3
SZT2-217ENST00000640484 NESP48681 1621 aa23.13■■□□□ 1.29
SZT2-217ENST00000640484 MAPKBP1O60336 1514 aa23.11■■□□□ 1.29
SZT2-217ENST00000640484 ARAP1Q96P48 1450 aa23.1■■□□□ 1.29
SZT2-217ENST00000640484 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.09■■□□□ 1.29
SZT2-217ENST00000640484 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.05■■□□□ 1.28
SZT2-217ENST00000640484 CCER2I3L3R5 266 aa23.03■■□□□ 1.28
SZT2-217ENST00000640484 CFTRP13569 1480 aa23.02■■□□□ 1.28
SZT2-217ENST00000640484 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.01■■□□□ 1.27
SZT2-217ENST00000640484 CCNB3Q8WWL7 1395 aa23■■□□□ 1.27
SZT2-217ENST00000640484 WDR97A6NE52 1622 aa22.99■■□□□ 1.27
SZT2-217ENST00000640484 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms