RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584446.5

GREB1L-211, Transcript of GREB1 like retinoic acid receptor coactivator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GREB1L, Length 3,020 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1L-211ENST00000584446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.7■■■□□ 2.51
GREB1L-211ENST00000584446 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.88■■□□□ 1.89
GREB1L-211ENST00000584446 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.75■■□□□ 1.87
GREB1L-211ENST00000584446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
GREB1L-211ENST00000584446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.01■■□□□ 1.75
GREB1L-211ENST00000584446 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
GREB1L-211ENST00000584446 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.48■■□□□ 1.67
GREB1L-211ENST00000584446 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.36■■□□□ 1.65
GREB1L-211ENST00000584446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.3■■□□□ 1.64
GREB1L-211ENST00000584446 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.07■■□□□ 1.6
GREB1L-211ENST00000584446 HRCP23327 699 aa24.99■■□□□ 1.59
GREB1L-211ENST00000584446 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.9■■□□□ 1.58
GREB1L-211ENST00000584446 NACADO15069 1562 aa24.9■■□□□ 1.58
GREB1L-211ENST00000584446 ABCC9O60706 1549 aa24.74■■□□□ 1.55
GREB1L-211ENST00000584446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.66■■□□□ 1.54
GREB1L-211ENST00000584446 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
GREB1L-211ENST00000584446 SCRIBQ14160 1630 aa24.55■■□□□ 1.52
GREB1L-211ENST00000584446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
GREB1L-211ENST00000584446 TRIM41Q8WV44 630 aa24.43■■□□□ 1.5
GREB1L-211ENST00000584446 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
GREB1L-211ENST00000584446 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
GREB1L-211ENST00000584446 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.36■■□□□ 1.49
GREB1L-211ENST00000584446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.27■■□□□ 1.48
GREB1L-211ENST00000584446 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.08■■□□□ 1.45
GREB1L-211ENST00000584446 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.95■■□□□ 1.42
GREB1L-211ENST00000584446 BICRAQ9NZM4 1560 aa23.94■■□□□ 1.42
GREB1L-211ENST00000584446 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
GREB1L-211ENST00000584446 WIZO95785 1651 aa23.83■■□□□ 1.41
GREB1L-211ENST00000584446 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
GREB1L-211ENST00000584446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
GREB1L-211ENST00000584446 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
GREB1L-211ENST00000584446 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
GREB1L-211ENST00000584446 ABCC8Q09428 1581 aa23.45■■□□□ 1.35
GREB1L-211ENST00000584446 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.4■■□□□ 1.34
GREB1L-211ENST00000584446 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
GREB1L-211ENST00000584446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
GREB1L-211ENST00000584446 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
GREB1L-211ENST00000584446 SMARCA4P51532 1647 aa23.32■■□□□ 1.32
GREB1L-211ENST00000584446 UBTFP17480 764 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
GREB1L-211ENST00000584446 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.3■■□□□ 1.32
GREB1L-211ENST00000584446 SOGA1O94964 1423 aa23.29■■□□□ 1.32
GREB1L-211ENST00000584446 SMARCA2P51531 1590 aa23.26■■□□□ 1.31
GREB1L-211ENST00000584446 CEP162Q5TB80 1403 aa23.24■■□□□ 1.31
GREB1L-211ENST00000584446 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.22■■□□□ 1.31
GREB1L-211ENST00000584446 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
GREB1L-211ENST00000584446 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.17■■□□□ 1.3
GREB1L-211ENST00000584446 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.12■■□□□ 1.29
GREB1L-211ENST00000584446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.29
GREB1L-211ENST00000584446 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
GREB1L-211ENST00000584446 EEA1Q15075 1411 aa23.02■■□□□ 1.27
GREB1L-211ENST00000584446 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
GREB1L-211ENST00000584446 GOLGA3Q08378 1498 aa22.96■■□□□ 1.27
GREB1L-211ENST00000584446 HMGXB3Q12766 1538 aa22.95■■□□□ 1.27
GREB1L-211ENST00000584446 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
GREB1L-211ENST00000584446 NEUROD1Q13562 356 aa22.91■■□□□ 1.26
GREB1L-211ENST00000584446 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
GREB1L-211ENST00000584446 NCAPD3P42695 1498 aa22.84■■□□□ 1.25
GREB1L-211ENST00000584446 APLP2Q06481 763 aa22.83■■□□□ 1.25
GREB1L-211ENST00000584446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.83■■□□□ 1.24
GREB1L-211ENST00000584446 SYNJ1O43426 1573 aa22.81■■□□□ 1.24
GREB1L-211ENST00000584446 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.8■■□□□ 1.24
GREB1L-211ENST00000584446 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
GREB1L-211ENST00000584446 CLIP1P30622 1438 aa22.8■■□□□ 1.24
GREB1L-211ENST00000584446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.79■■□□□ 1.24
GREB1L-211ENST00000584446 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
GREB1L-211ENST00000584446 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
GREB1L-211ENST00000584446 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
GREB1L-211ENST00000584446 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.74■■□□□ 1.23
GREB1L-211ENST00000584446 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
GREB1L-211ENST00000584446 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.68■■□□□ 1.22
GREB1L-211ENST00000584446 KIF21BO75037 1637 aa22.64■■□□□ 1.22
GREB1L-211ENST00000584446 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.64■■□□□ 1.22
GREB1L-211ENST00000584446 MIER1Q8N108 512 aa22.52■■□□□ 1.2
GREB1L-211ENST00000584446 PRDM2Q13029 1718 aa22.48■■□□□ 1.19
GREB1L-211ENST00000584446 TOP2BQ02880 1626 aa22.44■■□□□ 1.18
GREB1L-211ENST00000584446 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
GREB1L-211ENST00000584446 ITGAEP38570 1179 aa22.35■■□□□ 1.17
GREB1L-211ENST00000584446 PRXQ9BXM0 1461 aa22.31■■□□□ 1.16
GREB1L-211ENST00000584446 ARAP1Q96P48 1450 aa22.29■■□□□ 1.16
GREB1L-211ENST00000584446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.28■■□□□ 1.16
GREB1L-211ENST00000584446 KIF27Q86VH2 1401 aa22.28■■□□□ 1.16
GREB1L-211ENST00000584446 CUX1P39880 1505 aa22.26■■□□□ 1.15
GREB1L-211ENST00000584446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.26■■□□□ 1.15
GREB1L-211ENST00000584446 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
GREB1L-211ENST00000584446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.23■■□□□ 1.15
GREB1L-211ENST00000584446 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.16■■□□□ 1.14
GREB1L-211ENST00000584446 CFTRP13569 1480 aa22.14■■□□□ 1.13
GREB1L-211ENST00000584446 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.11■■□□□ 1.13
GREB1L-211ENST00000584446 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa22.1■■□□□ 1.13
GREB1L-211ENST00000584446 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
GREB1L-211ENST00000584446 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.09■■□□□ 1.13
GREB1L-211ENST00000584446 CUX2O14529 1486 aa22.08■■□□□ 1.13
GREB1L-211ENST00000584446 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
GREB1L-211ENST00000584446 P3H3Q8IVL6 736 aa22.06■■□□□ 1.12
GREB1L-211ENST00000584446 IGF1RP08069 1367 aa22.02■■□□□ 1.11
GREB1L-211ENST00000584446 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
GREB1L-211ENST00000584446 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.97■■□□□ 1.11
GREB1L-211ENST00000584446 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.96■■□□□ 1.11
GREB1L-211ENST00000584446 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.96■■□□□ 1.11
GREB1L-211ENST00000584446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.89■■□□□ 1.1
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