RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490916.5

PTPRG-AS1-208, PTPRG antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRG-AS1, Length 545 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.12■■□□□ 1.93
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 NISCHQ9Y2I1 1504 aa23.38■■□□□ 1.33
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.12■■□□□ 1.13
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 FOXD1Q16676 465 aa21.96■■□□□ 1.11
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ADRA2BP18089 450 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PPP6R1Q9UPN7 881 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 POTEDQ86YR6 584 aa20.92■□□□□ 0.94
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 MSH5O43196 834 aa20.74■□□□□ 0.91
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.73■□□□□ 0.91
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ABCC9O60706 1549 aa20.26■□□□□ 0.83
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 DCAF8L2P0C7V8 631 aa19.45■□□□□ 0.7
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa19.42■□□□□ 0.7
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 NACADO15069 1562 aa19.4■□□□□ 0.7
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.38■□□□□ 0.69
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.35■□□□□ 0.69
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 DNAJC5BQ9UF47 199 aa19.25■□□□□ 0.67
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP18.96■□□□□ 0.63
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SCRIBQ14160 1630 aa18.92■□□□□ 0.62
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 KCNA4P22459 653 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 DMRT2Q9Y5R5 561 aa18.84■□□□□ 0.61
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.68■□□□□ 0.58
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa18.67■□□□□ 0.58
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 NPM3O75607 178 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.2■□□□□ 0.5
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.17■□□□□ 0.5
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 DCAF8L1A6NGE4 600 aa18.16■□□□□ 0.5
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SMARCA4P51532 1647 aa18.12■□□□□ 0.49
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.01■□□□□ 0.47
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SMARCA2P51531 1590 aa17.96■□□□□ 0.47
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PEG3Q9GZU2 1588 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 WIZO95785 1651 aa17.85■□□□□ 0.45
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 HMGXB3Q12766 1538 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 NCAPD3P42695 1498 aa17.84■□□□□ 0.45
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.71■□□□□ 0.43
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa17.67■□□□□ 0.42
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 RNF39Q9H2S5 420 aa17.65■□□□□ 0.42
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SLC4A2P04920 1241 aa17.48■□□□□ 0.39
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 EHMT2Q96KQ7 1210 aa17.47■□□□□ 0.39
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 FOXD4L1Q9NU39 408 aa17.46■□□□□ 0.39
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CCDC88BA6NC98 1476 aa17.45■□□□□ 0.38
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ERCC6Q03468 1493 aa17.45■□□□□ 0.38
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.39■□□□□ 0.37
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 NESP48681 1621 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CUX2O14529 1486 aa17.36■□□□□ 0.37
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.35■□□□□ 0.37
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CFTRP13569 1480 aa17.31■□□□□ 0.36
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PRDM2Q13029 1718 aa17.29■□□□□ 0.36
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.28■□□□□ 0.36
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.26■□□□□ 0.35
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ZBTB22O15209 634 aa17.24■□□□□ 0.35
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP17.24■□□□□ 0.35
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.21■□□□□ 0.35
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.18■□□□□ 0.34
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.17■□□□□ 0.34
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.17■□□□□ 0.34
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 APLP2Q06481 763 aa17.16■□□□□ 0.34
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP17.15■□□□□ 0.34
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.06■□□□□ 0.32
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ABCC8Q09428 1581 aa16.99■□□□□ 0.31
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 WDR62O43379 1518 aa16.98■□□□□ 0.31
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 TRIM41Q8WV44 630 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.97■□□□□ 0.31
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.3
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 TOPBP1Q92547 1522 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ATXN8OSP0DMR3 200 aa16.93■□□□□ 0.3
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CUX1P39880 1505 aa16.89■□□□□ 0.29
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 TOP2BQ02880 1626 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa16.86■□□□□ 0.29
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 CAPN15O75808 1086 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 SYNJ1O43426 1573 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 FGD5Q6ZNL6 1462 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
PTPRG-AS1-208ENST00000490916 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms