RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482785.1

SHQ1-208, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 3

Gene SHQ1, Length 502 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-208ENST00000482785 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SHQ1-208ENST00000482785 CHIC1Q5VXU3 224 aa12.74□□□□□ -0.37
SHQ1-208ENST00000482785 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
SHQ1-208ENST00000482785 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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SHQ1-208ENST00000482785 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa11.01□□□□□ -0.65
SHQ1-208ENST00000482785 ABCC9O60706 1549 aa10.49□□□□□ -0.73
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SHQ1-208ENST00000482785 PLPPR3Q6T4P5 718 aa10.34□□□□□ -0.75
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SHQ1-208ENST00000482785 POTEDQ86YR6 584 aa9.18□□□□□ -0.94
SHQ1-208ENST00000482785 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa9.17□□□□□ -0.94
SHQ1-208ENST00000482785 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.17□□□□□ -0.94
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SHQ1-208ENST00000482785 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
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SHQ1-208ENST00000482785 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.04□□□□□ -0.96
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SHQ1-208ENST00000482785 DMRT2Q9Y5R5 561 aa8.96□□□□□ -0.98
SHQ1-208ENST00000482785 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa8.95□□□□□ -0.98
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SHQ1-208ENST00000482785 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa8.95□□□□□ -0.98
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SHQ1-208ENST00000482785 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SHQ1-208ENST00000482785 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
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SHQ1-208ENST00000482785 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
SHQ1-208ENST00000482785 CYB5RLQ6IPT4 315 aa8.8□□□□□ -1
SHQ1-208ENST00000482785 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SHQ1-208ENST00000482785 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa8.78□□□□□ -1
SHQ1-208ENST00000482785 ARHGEF11O15085 1522 aa8.75□□□□□ -1.01
SHQ1-208ENST00000482785 DCAF8L2P0C7V8 631 aa8.75□□□□□ -1.01
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SHQ1-208ENST00000482785 DISP3Q9P2K9 1392 aa8.72□□□□□ -1.01
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SHQ1-208ENST00000482785 NESP48681 1621 aa8.69□□□□□ -1.02
SHQ1-208ENST00000482785 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa8.68□□□□□ -1.02
SHQ1-208ENST00000482785 ERCC6L2Q5T890 1561 aa8.68□□□□□ -1.02
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SHQ1-208ENST00000482785 ARAP1Q96P48 1450 aa8.6□□□□□ -1.03
SHQ1-208ENST00000482785 HECW2Q9P2P5 1572 aa8.57□□□□□ -1.04
SHQ1-208ENST00000482785 ZBTB22O15209 634 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-208ENST00000482785 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-208ENST00000482785 SLC24A1O60721 1099 aa8.5□□□□□ -1.05
SHQ1-208ENST00000482785 DCAF8L1A6NGE4 600 aa8.47□□□□□ -1.05
SHQ1-208ENST00000482785 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa8.46□□□□□ -1.06
SHQ1-208ENST00000482785 SYNJ2O15056 1496 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-208ENST00000482785 SCRIBQ14160 1630 aa8.43□□□□□ -1.06
SHQ1-208ENST00000482785 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.41□□□□□ -1.06
SHQ1-208ENST00000482785 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
SHQ1-208ENST00000482785 MYO15BQ96JP2 1530 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-208ENST00000482785 WDR62O43379 1518 aa8.35□□□□□ -1.07
SHQ1-208ENST00000482785 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SHQ1-208ENST00000482785 SLC4A2P04920 1241 aa8.33□□□□□ -1.08
SHQ1-208ENST00000482785 MRC2Q9UBG0 1479 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-208ENST00000482785 RNF39Q9H2S5 420 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-208ENST00000482785 NCAPD3P42695 1498 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-208ENST00000482785 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa8.31□□□□□ -1.08
SHQ1-208ENST00000482785 PDS5BQ9NTI5 1447 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1-208ENST00000482785 ADGRL1O94910 1474 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-208ENST00000482785 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-208ENST00000482785 KIF13AQ9H1H9 1805 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-208ENST00000482785 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
SHQ1-208ENST00000482785 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
SHQ1-208ENST00000482785 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SHQ1-208ENST00000482785 CHD1O14646 1710 aa8.19□□□□□ -1.1
SHQ1-208ENST00000482785 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SHQ1-208ENST00000482785 CERKQ8TCT0 537 aa8.16□□□□□ -1.1
SHQ1-208ENST00000482785 KDM6BO15054 1643 aa8.14□□□□□ -1.11
SHQ1-208ENST00000482785 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa8.13□□□□□ -1.11
SHQ1-208ENST00000482785 HMGXB3Q12766 1538 aa8.11□□□□□ -1.11
SHQ1-208ENST00000482785 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
SHQ1-208ENST00000482785 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
SHQ1-208ENST00000482785 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.08□□□□□ -1.12
SHQ1-208ENST00000482785 SMARCA4P51532 1647 aa8.07□□□□□ -1.12
SHQ1-208ENST00000482785 FBLN2P98095 1184 aa8.06□□□□□ -1.12
SHQ1-208ENST00000482785 FKBP8Q14318 412 aa8.05□□□□□ -1.12
SHQ1-208ENST00000482785 GAPVD1Q14C86 1478 aa8.03□□□□□ -1.12
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