RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391293.1

5S_rRNA.2-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 112 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DNAJC5BQ9UF47 199 aa6.17□□□□□ -1.42
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.11□□□□□ -1.43
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ABCC9O60706 1549 aa5.94□□□□□ -1.46
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NISCHQ9Y2I1 1504 aa5.61□□□□□ -1.51
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TRIM41Q8WV44 630 aa5.54□□□□□ -1.52
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CECR2Q9BXF3 1484 aa5.42□□□□□ -1.54
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP5.41□□□□□ -1.54
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CUX2O14529 1486 aa5.39□□□□□ -1.55
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa5.34□□□□□ -1.55
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa5.32□□□□□ -1.56
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa5.28□□□□□ -1.56
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 BICRAQ9NZM4 1560 aa5.25□□□□□ -1.57
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 UNC13AQ9UPW8 1703 aa5.21□□□□□ -1.58
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ERCC6Q03468 1493 aa5.15□□□□□ -1.58
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NACADO15069 1562 aa5.15□□□□□ -1.59
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa5.11□□□□□ -1.59
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TRHP20396 242 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa5.03□□□□□ -1.6
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa5.03□□□□□ -1.6
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa5.03□□□□□ -1.6
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LMTK3Q96Q04 1460 aa5.01□□□□□ -1.61
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SOCS7O14512 581 aa5.01□□□□□ -1.61
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 OSCARQ8IYS5 282 aa4.97□□□□□ -1.61
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ARHGEF11O15085 1522 aa4.97□□□□□ -1.61
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ILDR2Q71H61 639 aa4.95□□□□□ -1.62
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NESP48681 1621 aa4.94□□□□□ -1.62
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DCAF8L2P0C7V8 631 aa4.91□□□□□ -1.62
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CYB5RLQ6IPT4 315 aa4.91□□□□□ -1.62
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FBXO41Q8TF61 875 aa4.91□□□□□ -1.62
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMARCA2P51531 1590 aa4.9□□□□□ -1.63
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MYO15BQ96JP2 1530 aa4.89□□□□□ -1.63
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ARAP1Q96P48 1450 aa4.88□□□□□ -1.63
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ERCC6L2Q5T890 1561 aa4.87□□□□□ -1.63
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa4.86□□□□□ -1.63
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SCRIBQ14160 1630 aa4.83□□□□□ -1.64
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DISP3Q9P2K9 1392 aa4.82□□□□□ -1.64
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HECW2Q9P2P5 1572 aa4.82□□□□□ -1.64
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 WDR62O43379 1518 aa4.8□□□□□ -1.64
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 NCAPD3P42695 1498 aa4.79□□□□□ -1.64
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MRC2Q9UBG0 1479 aa4.77□□□□□ -1.65
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa4.76□□□□□ -1.65
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PDS5BQ9NTI5 1447 aa4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SYNJ2O15056 1496 aa4.74□□□□□ -1.65
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HMGXB3Q12766 1538 aa4.69□□□□□ -1.66
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa4.69□□□□□ -1.66
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADGRL1O94910 1474 aa4.68□□□□□ -1.66
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CHD1O14646 1710 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CEP164Q9UPV0 1460 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SMARCA4P51532 1647 aa4.61□□□□□ -1.67
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KDM6BO15054 1643 aa4.6□□□□□ -1.67
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CADPSQ9ULU8 1353 aa4.59□□□□□ -1.67
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 GAPVD1Q14C86 1478 aa4.57□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FANCD2Q9BXW9 1451 aa4.56□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CERKQ8TCT0 537 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IFT140Q96RY7 1462 aa4.55□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa4.53□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FBLN2P98095 1184 aa4.52□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ABCC10Q5T3U5 1492 aa4.51□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 DIP2BQ9P265 1576 aa4.5□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.5□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SYNJ1O43426 1573 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PEG3Q9GZU2 1588 aa4.48□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TOP2BQ02880 1626 aa4.46□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MAPKBP1O60336 1514 aa4.44□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CFTRP13569 1480 aa4.43□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TSPOAP1O95153 1857 aa4.42□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 IFFO2Q5TF58 517 aa4.41□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PTPRMP28827 1452 aa4.41□□□□□ -1.7
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TOPBP1Q92547 1522 aa4.4□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 HSPA2P54652 639 aa4.38□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 CEP170Q5SW79 1584 aa4.38□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 MROH2BQ7Z745 1585 aa4.36□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 ADAMTSL3P82987 1691 aa4.34□□□□□ -1.71
5S_rRNA.2-201ENST00000391293 KIF21BO75037 1637 aa4.33□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms