RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000224820.1

Zkscan3-208, Transcript of Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

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Gene Zkscan3, Length 5,398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.2■■■□□ 2.1
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa26.03■■□□□ 1.76
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NischQ80TM9 1593 aa25.29■■□□□ 1.64
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa25.12■■□□□ 1.61
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.85■■□□□ 1.57
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Trim41Q5NCC3 630 aa24.76■■□□□ 1.55
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Wdr66E9Q743 1299 aa24.52■■□□□ 1.52
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gab3Q8BSM5 595 aa24.51■■□□□ 1.51
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zeb1Q64318 1117 aa24.34■■□□□ 1.49
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Npm2Q80W85 207 aa24.29■■□□□ 1.48
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ube2uB1AUC4 352 aa24.17■■□□□ 1.46
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.13■■□□□ 1.45
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Myt1lP97500 1187 aa24.07■■□□□ 1.44
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rtl1Q7M732 1744 aa23.95■■□□□ 1.42
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NefmP08553 848 aa23.93■■□□□ 1.42
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 HrcG5E8J6 738 aa23.92■■□□□ 1.42
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Abcc9P70170 1546 aa23.65■■□□□ 1.38
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 CenpbP27790 599 aa23.49■■□□□ 1.35
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Stra8P70278 393 aa23.47■■□□□ 1.35
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Il27Q8K3I6 234 aa23.22■■□□□ 1.31
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.22■■□□□ 1.31
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.08■■□□□ 1.29
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.06■■□□□ 1.28
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa22.92■■□□□ 1.26
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.91■■□□□ 1.26
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.89■■□□□ 1.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NclP09405 707 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 TonslQ6NZL6 1363 aa22.8■■□□□ 1.24
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.77■■□□□ 1.24
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mier1Q5UAK0 511 aa22.75■■□□□ 1.23
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Amer1Q7TS75 1132 aa22.7■■□□□ 1.22
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.67■■□□□ 1.22
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Neurod1Q60867 357 aa22.66■■□□□ 1.22
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa22.58■■□□□ 1.2
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NeflP08551 543 aa22.5■■□□□ 1.19
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 ClspnQ80YR7 1315 aa22.41■■□□□ 1.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.4■■□□□ 1.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Os9Q8K2C7 672 aa22.39■■□□□ 1.18
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Cep164Q5DU05 1446 aa22.38■■□□□ 1.17
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.3■■□□□ 1.16
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.23■■□□□ 1.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rtl5Q5DTT4 599 aa22.22■■□□□ 1.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Chic1Q8CBW7 227 aa22.17■■□□□ 1.14
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Clip1Q922J3 1391 aa22.15■■□□□ 1.14
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Anp32aO35381 247 aa22■■□□□ 1.11
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Sall2Q9QX96 1004 aa21.99■■□□□ 1.11
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.98■■□□□ 1.11
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ccer2J3QPU5 274 aa21.98■■□□□ 1.11
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Eid3Q3V124 375 aa21.96■■□□□ 1.11
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Anks4bQ8K3X6 423 aa21.91■■□□□ 1.1
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 NacadQ5SWP3 1504 aa21.87■■□□□ 1.09
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa21.86■■□□□ 1.09
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa21.85■■□□□ 1.09
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa21.82■■□□□ 1.08
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Baz1aO88379 1555 aa21.8■■□□□ 1.08
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Nlrp6Q91WS2 869 aa21.72■■□□□ 1.07
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Erich6D3Z6S9 713 aa21.71■■□□□ 1.07
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Zbtb4Q5F293 982 aa21.7■■□□□ 1.06
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.69■■□□□ 1.06
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Golga3P55937 1487 aa21.67■■□□□ 1.06
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Aplp2Q06335 707 aa21.66■■□□□ 1.06
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Csrnp3P59055 597 aa21.66■■□□□ 1.06
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 BlmO88700 1416 aa21.65■■□□□ 1.06
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm13697A2AK42 830 aa21.64■■□□□ 1.06
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa21.64■■□□□ 1.06
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Setd5Q5XJV7 1441 aa21.57■■□□□ 1.04
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Atp1b4Q99ME6 356 aa21.54■■□□□ 1.04
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Chic2Q9D9G3 165 aa21.54■■□□□ 1.04
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 DaxxO35613 739 aa21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Calr4Q3TQS0 420 aa21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Gm38655A0A286YDK6 273 aa21.53■■□□□ 1.04
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Upf2A2AT37 1269 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Polr3glQ8R0C0 218 aa21.45■■□□□ 1.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Clstn2Q9ER65 966 aa21.44■■□□□ 1.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa21.44■■□□□ 1.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Mrs2Q5NCE8 434 aa21.4■■□□□ 1.02
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.39■■□□□ 1.01
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Eea1Q8BL66 1411 aa21.37■■□□□ 1.01
Zkscan3-208ENSMUST00000224820 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.36■■□□□ 1.01
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