RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000159616.1

Lrrtm1-202, Transcript of Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Lrrtm1, Length 2,541 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 NischQ80TM9 1593 aa31.18■■■□□ 2.58
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa30.45■■■□□ 2.47
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Abcc9P70170 1546 aa30.32■■■□□ 2.44
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Abcc8B2RUS7 1588 aa29.48■■■□□ 2.31
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rtl1Q7M732 1744 aa29.42■■■□□ 2.3
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rhox8Q6VSS7 320 aa29.28■■■□□ 2.28
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ccdc180J3QNE4 1664 aa28.96■■■□□ 2.23
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa28.28■■■□□ 2.12
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Dcaf1Q80TR8 1506 aa27.64■■■□□ 2.02
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP27.61■■■□□ 2.01
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 HrcG5E8J6 738 aa27.54■■■□□ 2
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa27.35■■□□□ 1.97
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 ScribQ80U72 1612 aa27.24■■□□□ 1.95
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa27.12■■□□□ 1.93
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Baz1aO88379 1555 aa27.06■■□□□ 1.92
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kdm5dQ62240 1548 aa26.84■■□□□ 1.89
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Trim41Q5NCC3 630 aa26.77■■□□□ 1.88
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Pcgf6Q99NA9 353 aa26.7■■□□□ 1.87
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 NacadQ5SWP3 1504 aa26.57■■□□□ 1.84
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cep164Q5DU05 1446 aa26.57■■□□□ 1.84
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Smarca2Q6DIC0 1577 aa26.5■■□□□ 1.83
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Crybg2B7ZCC2 1516 aa26.5■■□□□ 1.83
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Sycp2Q9CUU3 1500 aa25.97■■□□□ 1.75
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Chic1Q8CBW7 227 aa25.95■■□□□ 1.74
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cngb1E1AZ71 1325 aa25.88■■□□□ 1.73
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Gab3Q8BSM5 595 aa25.8■■□□□ 1.72
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 NefmP08553 848 aa25.78■■□□□ 1.72
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa25.77■■□□□ 1.72
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Golga3P55937 1487 aa25.77■■□□□ 1.72
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa25.7■■□□□ 1.7
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Mier1Q5UAK0 511 aa25.64■■□□□ 1.69
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Neurod1Q60867 357 aa25.63■■□□□ 1.69
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Zeb1Q64318 1117 aa25.62■■□□□ 1.69
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Synj1Q8CHC4 1574 aa25.6■■□□□ 1.69
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Top2bQ64511 1612 aa25.43■■□□□ 1.66
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 CftrP26361 1476 aa25.41■■□□□ 1.66
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Sall2Q9QX96 1004 aa25.37■■□□□ 1.65
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 BicraF8VPZ9 1578 aa25.34■■□□□ 1.65
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa25.24■■□□□ 1.63
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa25.16■■□□□ 1.62
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa25.13■■□□□ 1.61
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Anks4bQ8K3X6 423 aa25.08■■□□□ 1.61
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 UbtfP25976 765 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Fmn1Q05860 1466 aa25.01■■□□□ 1.59
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cep162Q6ZQ06 1403 aa24.93■■□□□ 1.58
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Wdr66E9Q743 1299 aa24.91■■□□□ 1.58
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 ClspnQ80YR7 1315 aa24.88■■□□□ 1.57
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa24.79■■□□□ 1.56
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Csrnp3P59055 597 aa24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Myt1lP97500 1187 aa24.76■■□□□ 1.55
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 TonslQ6NZL6 1363 aa24.7■■□□□ 1.54
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Clip1Q922J3 1391 aa24.63■■□□□ 1.53
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Npm2Q80W85 207 aa24.61■■□□□ 1.53
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa24.59■■□□□ 1.53
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa24.56■■□□□ 1.52
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Aplp2Q06335 707 aa24.53■■□□□ 1.52
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa24.52■■□□□ 1.52
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa24.5■■□□□ 1.51
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 TnnQ80Z71 1560 aa24.44■■□□□ 1.5
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Arhgap35Q91YM2 1499 aa24.38■■□□□ 1.49
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Eea1Q8BL66 1411 aa24.31■■□□□ 1.48
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Arap1Q4LDD4 1452 aa24.3■■□□□ 1.48
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 NrkQ9R0G8 1455 aa24.3■■□□□ 1.48
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Kdm5bQ80Y84 1544 aa24.28■■□□□ 1.48
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 CenpbP27790 599 aa24.28■■□□□ 1.48
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 PtprkP35822 1457 aa24.24■■□□□ 1.47
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa24.23■■□□□ 1.47
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ccdc18Q640L5 1455 aa24.22■■□□□ 1.47
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Myt1Q8CFC2 1127 aa24.2■■□□□ 1.46
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Setd5Q5XJV7 1441 aa24.14■■□□□ 1.46
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Map3k1P53349 1493 aa24.13■■□□□ 1.45
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa24.11■■□□□ 1.45
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Lamc3Q9R0B6 1581 aa24.1■■□□□ 1.45
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Shroom4Q1W617 1475 aa24.1■■□□□ 1.45
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Eid3Q3V124 375 aa24.1■■□□□ 1.45
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Tiam1Q60610 1591 aa24.07■■□□□ 1.44
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa24.05■■□□□ 1.44
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Baz1bQ9Z277 1479 aa24.04■■□□□ 1.44
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Frmpd1A2AKB4 1549 aa24.02■■□□□ 1.44
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Gm38655A0A286YDK6 273 aa24.01■■□□□ 1.43
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Tnnt3Q9QZ47 272 aa24■■□□□ 1.43
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Camsap1A2AHC3 1581 aa23.99■■□□□ 1.43
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Wdr62Q3U3T8 1523 aa23.99■■□□□ 1.43
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Naip1Q9QWK5 1403 aa23.96■■□□□ 1.43
Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 Erich3F6QRE9 1637 aa23.96■■□□□ 1.43
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