Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1F9

Tchh, Trichohyalin, mousemouse

Predictions only

Length 1,599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchhA0A0B4J1F9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC63,64■■■■■ 7,78
TchhA0A0B4J1F9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC59,25■■■■■ 7,08
TchhA0A0B4J1F9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58,01■■■■■ 6,88
TchhA0A0B4J1F9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC55,59■■■■■ 6,49
TchhA0A0B4J1F9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC55,11■■■■■ 6,41
TchhA0A0B4J1F9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC53,95■■■■■ 6,23
TchhA0A0B4J1F9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53,79■■■■■ 6,2
TchhA0A0B4J1F9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53,51■■■■■ 6,16
TchhA0A0B4J1F9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC53,42■■■■■ 6,14
TchhA0A0B4J1F9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53,21■■■■■ 6,11
TchhA0A0B4J1F9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC53,02■■■■■ 6,08
TchhA0A0B4J1F9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC51,89■■■■■ 5,9
TchhA0A0B4J1F9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC51,45■■■■■ 5,83
TchhA0A0B4J1F9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51,38■■■■■ 5,82
TchhA0A0B4J1F9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,35■■■■■ 5,81
TchhA0A0B4J1F9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,24■■■■■ 5,79
TchhA0A0B4J1F9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,09■■■■■ 5,77
TchhA0A0B4J1F9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,89■■■■■ 5,74
TchhA0A0B4J1F9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC50,7■■■■■ 5,71
TchhA0A0B4J1F9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,63■■■■■ 5,7
TchhA0A0B4J1F9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,51■■■■■ 5,68
TchhA0A0B4J1F9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,49■■■■■ 5,67
TchhA0A0B4J1F9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC50,38■■■■■ 5,66
TchhA0A0B4J1F9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC50,38■■■■■ 5,66
TchhA0A0B4J1F9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,9■■■■■ 5,58
TchhA0A0B4J1F9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49,51■■■■■ 5,52
TchhA0A0B4J1F9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,48■■■■■ 5,51
TchhA0A0B4J1F9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,41■■■■■ 5,5
TchhA0A0B4J1F9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC49,39■■■■■ 5,5
TchhA0A0B4J1F9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC49,28■■■■■ 5,48
TchhA0A0B4J1F9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,23■■■■■ 5,47
TchhA0A0B4J1F9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,07■■■■■ 5,45
TchhA0A0B4J1F9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49,05■■■■■ 5,44
TchhA0A0B4J1F9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,95■■■■■ 5,43
TchhA0A0B4J1F9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48,94■■■■■ 5,43
TchhA0A0B4J1F9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC48,78■■■■■ 5,4
TchhA0A0B4J1F9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC48,71■■■■■ 5,39
TchhA0A0B4J1F9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC48,7■■■■■ 5,39
TchhA0A0B4J1F9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC48,42■■■■■ 5,34
TchhA0A0B4J1F9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,32■■■■■ 5,33
TchhA0A0B4J1F9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC48,11■■■■■ 5,29
TchhA0A0B4J1F9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC48,11■■■■■ 5,29
TchhA0A0B4J1F9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,96■■■■■ 5,27
TchhA0A0B4J1F9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC47,92■■■■■ 5,26
TchhA0A0B4J1F9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,9■■■■■ 5,26
TchhA0A0B4J1F9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC47,79■■■■■ 5,24
TchhA0A0B4J1F9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47,68■■■■■ 5,22
TchhA0A0B4J1F9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,65■■■■■ 5,22
TchhA0A0B4J1F9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC47,64■■■■■ 5,22
TchhA0A0B4J1F9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,62■■■■■ 5,21
TchhA0A0B4J1F9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47,51■■■■■ 5,2
TchhA0A0B4J1F9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC47,5■■■■■ 5,19
TchhA0A0B4J1F9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC47,48■■■■■ 5,19
TchhA0A0B4J1F9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC47,4■■■■■ 5,18
TchhA0A0B4J1F9 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47,32■■■■■ 5,17
TchhA0A0B4J1F9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC47,31■■■■■ 5,16
TchhA0A0B4J1F9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC47,26■■■■■ 5,16
TchhA0A0B4J1F9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47,26■■■■■ 5,16
TchhA0A0B4J1F9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC47,16■■■■■ 5,14
TchhA0A0B4J1F9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC47,15■■■■■ 5,14
TchhA0A0B4J1F9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,14■■■■■ 5,14
TchhA0A0B4J1F9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC47,13■■■■■ 5,14
TchhA0A0B4J1F9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,08■■■■■ 5,13
TchhA0A0B4J1F9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC46,92■■■■■ 5,1
TchhA0A0B4J1F9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC46,79■■■■■ 5,08
TchhA0A0B4J1F9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,68■■■■■ 5,06
TchhA0A0B4J1F9 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC46,67■■■■■ 5,06
TchhA0A0B4J1F9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,59■■■■■ 5,05
TchhA0A0B4J1F9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC46,56■■■■■ 5,04
TchhA0A0B4J1F9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC46,5■■■■■ 5,03
TchhA0A0B4J1F9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,45■■■■■ 5,03
TchhA0A0B4J1F9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,44■■■■■ 5,03
TchhA0A0B4J1F9 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC46,26■■■■■ 5
TchhA0A0B4J1F9 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC46,24■■■■■ 4,99
TchhA0A0B4J1F9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46,23■■■■■ 4,99
TchhA0A0B4J1F9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC46,22■■■■■ 4,99
TchhA0A0B4J1F9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,19■■■■■ 4,99
TchhA0A0B4J1F9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46,18■■■■■ 4,98
TchhA0A0B4J1F9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC46,16■■■■■ 4,98
TchhA0A0B4J1F9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46,09■■■■■ 4,97
TchhA0A0B4J1F9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46,04■■■■■ 4,96
TchhA0A0B4J1F9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,98■■■■■ 4,95
TchhA0A0B4J1F9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC45,89■■■■■ 4,94
TchhA0A0B4J1F9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,84■■■■■ 4,93
TchhA0A0B4J1F9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC45,77■■■■■ 4,92
TchhA0A0B4J1F9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC45,71■■■■■ 4,91
TchhA0A0B4J1F9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC45,69■■■■■ 4,9
TchhA0A0B4J1F9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,68■■■■■ 4,9
TchhA0A0B4J1F9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45,57■■■■■ 4,89
TchhA0A0B4J1F9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC45,55■■■■■ 4,88
TchhA0A0B4J1F9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC45,55■■■■■ 4,88
TchhA0A0B4J1F9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45,53■■■■■ 4,88
TchhA0A0B4J1F9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,51■■■■■ 4,88
TchhA0A0B4J1F9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45,51■■■■■ 4,88
TchhA0A0B4J1F9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45,5■■■■■ 4,87
TchhA0A0B4J1F9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC45,48■■■■■ 4,87
TchhA0A0B4J1F9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45,47■■■■■ 4,87
TchhA0A0B4J1F9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC45,41■■■■■ 4,86
TchhA0A0B4J1F9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC45,37■■■■■ 4,85
TchhA0A0B4J1F9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC45,35■■■■■ 4,85
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