Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC66,1■■■■■ 8,17
Fmn1Q05860 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC61,3■■■■■ 7,4
Fmn1Q05860 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60,17■■■■■ 7,22
Fmn1Q05860 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC57,58■■■■■ 6,81
Fmn1Q05860 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC57,57■■■■■ 6,81
Fmn1Q05860 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC56,44■■■■■ 6,63
Fmn1Q05860 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC55,86■■■■■ 6,53
Fmn1Q05860 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55,76■■■■■ 6,52
Fmn1Q05860 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC55,32■■■■■ 6,45
Fmn1Q05860 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC55,12■■■■■ 6,41
Fmn1Q05860 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55,12■■■■■ 6,41
Fmn1Q05860 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,92■■■■■ 6,38
Fmn1Q05860 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54,3■■■■■ 6,28
Fmn1Q05860 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53,61■■■■■ 6,17
Fmn1Q05860 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC53,56■■■■■ 6,16
Fmn1Q05860 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53,32■■■■■ 6,13
Fmn1Q05860 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC53,22■■■■■ 6,11
Fmn1Q05860 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC53■■■■■ 6,07
Fmn1Q05860 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52,98■■■■■ 6,07
Fmn1Q05860 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,92■■■■■ 6,06
Fmn1Q05860 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52,67■■■■■ 6,02
Fmn1Q05860 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC52,52■■■■■ 6
Fmn1Q05860 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,5■■■■■ 5,99
Fmn1Q05860 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,47■■■■■ 5,99
Fmn1Q05860 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,41■■■■■ 5,98
Fmn1Q05860 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,33■■■■■ 5,97
Fmn1Q05860 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,26■■■■■ 5,96
Fmn1Q05860 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC52,24■■■■■ 5,95
Fmn1Q05860 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC52,18■■■■■ 5,94
Fmn1Q05860 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52,02■■■■■ 5,92
Fmn1Q05860 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51,91■■■■■ 5,9
Fmn1Q05860 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51,88■■■■■ 5,9
Fmn1Q05860 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC51,68■■■■■ 5,86
Fmn1Q05860 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51,39■■■■■ 5,82
Fmn1Q05860 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51,34■■■■■ 5,81
Fmn1Q05860 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5,76
Fmn1Q05860 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC50,92■■■■■ 5,74
Fmn1Q05860 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50,87■■■■■ 5,73
Fmn1Q05860 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC50,81■■■■■ 5,72
Fmn1Q05860 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50,69■■■■■ 5,71
Fmn1Q05860 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC50,61■■■■■ 5,69
Fmn1Q05860 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,59■■■■■ 5,69
Fmn1Q05860 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC50,5■■■■■ 5,67
Fmn1Q05860 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC50,47■■■■■ 5,67
Fmn1Q05860 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC50,39■■■■■ 5,66
Fmn1Q05860 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50,13■■■■■ 5,62
Fmn1Q05860 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC50,09■■■■■ 5,61
Fmn1Q05860 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC50,01■■■■■ 5,6
Fmn1Q05860 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,77■■■■■ 5,56
Fmn1Q05860 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,76■■■■■ 5,56
Fmn1Q05860 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC49,63■■■■■ 5,54
Fmn1Q05860 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC49,56■■■■■ 5,52
Fmn1Q05860 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC49,46■■■■■ 5,51
Fmn1Q05860 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC49,44■■■■■ 5,51
Fmn1Q05860 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,38■■■■■ 5,5
Fmn1Q05860 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC49,37■■■■■ 5,49
Fmn1Q05860 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,32■■■■■ 5,49
Fmn1Q05860 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49,26■■■■■ 5,48
Fmn1Q05860 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC49,21■■■■■ 5,47
Fmn1Q05860 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC49,17■■■■■ 5,46
Fmn1Q05860 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC49,16■■■■■ 5,46
Fmn1Q05860 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49,15■■■■■ 5,46
Fmn1Q05860 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49,12■■■■■ 5,45
Fmn1Q05860 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC49,11■■■■■ 5,45
Fmn1Q05860 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49,08■■■■■ 5,45
Fmn1Q05860 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,95■■■■■ 5,43
Fmn1Q05860 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC48,91■■■■■ 5,42
Fmn1Q05860 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC48,87■■■■■ 5,41
Fmn1Q05860 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC48,84■■■■■ 5,41
Fmn1Q05860 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC48,76■■■■■ 5,4
Fmn1Q05860 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,72■■■■■ 5,39
Fmn1Q05860 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC48,7■■■■■ 5,39
Fmn1Q05860 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,68■■■■■ 5,38
Fmn1Q05860 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC48,62■■■■■ 5,37
Fmn1Q05860 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,61■■■■■ 5,37
Fmn1Q05860 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC48,61■■■■■ 5,37
Fmn1Q05860 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,58■■■■■ 5,37
Fmn1Q05860 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,57■■■■■ 5,37
Fmn1Q05860 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,55■■■■■ 5,36
Fmn1Q05860 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC48,42■■■■■ 5,34
Fmn1Q05860 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC48,37■■■■■ 5,33
Fmn1Q05860 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,36■■■■■ 5,33
Fmn1Q05860 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48,31■■■■■ 5,32
Fmn1Q05860 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC48,25■■■■■ 5,31
Fmn1Q05860 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,23■■■■■ 5,31
Fmn1Q05860 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC48,23■■■■■ 5,31
Fmn1Q05860 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC48,11■■■■■ 5,29
Fmn1Q05860 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48,07■■■■■ 5,29
Fmn1Q05860 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC48,03■■■■■ 5,28
Fmn1Q05860 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48,01■■■■■ 5,28
Fmn1Q05860 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC47,95■■■■■ 5,27
Fmn1Q05860 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,95■■■■■ 5,27
Fmn1Q05860 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,91■■■■■ 5,26
Fmn1Q05860 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,87■■■■■ 5,25
Fmn1Q05860 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,86■■■■■ 5,25
Fmn1Q05860 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC47,85■■■■■ 5,25
Fmn1Q05860 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47,76■■■■■ 5,24
Fmn1Q05860 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,74■■■■■ 5,23
Fmn1Q05860 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47,7■■■■■ 5,23
Fmn1Q05860 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC47,64■■■■■ 5,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20,1 ms