Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC66.76■■■■■ 8.28
Top2bQ64511 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC61.99■■■■■ 7.51
Top2bQ64511 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC60.63■■■■■ 7.3
Top2bQ64511 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC58.26■■■■■ 6.92
Top2bQ64511 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC58.19■■■■■ 6.91
Top2bQ64511 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC57.19■■■■■ 6.75
Top2bQ64511 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC56.44■■■■■ 6.63
Top2bQ64511 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.29■■■■■ 6.6
Top2bQ64511 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.96■■■■■ 6.55
Top2bQ64511 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC55.84■■■■■ 6.53
Top2bQ64511 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.72■■■■■ 6.51
Top2bQ64511 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC55.61■■■■■ 6.49
Top2bQ64511 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.98■■■■■ 6.39
Top2bQ64511 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC54.5■■■■■ 6.31
Top2bQ64511 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.12■■■■■ 6.25
Top2bQ64511 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.08■■■■■ 6.25
Top2bQ64511 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.07■■■■■ 6.25
Top2bQ64511 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC54.05■■■■■ 6.24
Top2bQ64511 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC54.05■■■■■ 6.24
Top2bQ64511 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC53.77■■■■■ 6.2
Top2bQ64511 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC53.41■■■■■ 6.14
Top2bQ64511 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.25■■■■■ 6.12
Top2bQ64511 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.21■■■■■ 6.11
Top2bQ64511 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC53.21■■■■■ 6.11
Top2bQ64511 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.03■■■■■ 6.08
Top2bQ64511 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
Top2bQ64511 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
Top2bQ64511 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC52.77■■■■■ 6.04
Top2bQ64511 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC52.68■■■■■ 6.02
Top2bQ64511 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.58■■■■■ 6.01
Top2bQ64511 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6.01
Top2bQ64511 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.56■■■■■ 6
Top2bQ64511 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC52.37■■■■■ 5.97
Top2bQ64511 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.05■■■■■ 5.92
Top2bQ64511 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.82■■■■■ 5.89
Top2bQ64511 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
Top2bQ64511 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.57■■■■■ 5.85
Top2bQ64511 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC51.53■■■■■ 5.84
Top2bQ64511 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC51.31■■■■■ 5.81
Top2bQ64511 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC51.3■■■■■ 5.8
Top2bQ64511 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.29■■■■■ 5.8
Top2bQ64511 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
Top2bQ64511 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC51.05■■■■■ 5.76
Top2bQ64511 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.01■■■■■ 5.76
Top2bQ64511 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC50.93■■■■■ 5.74
Top2bQ64511 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC50.93■■■■■ 5.74
Top2bQ64511 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.75■■■■■ 5.71
Top2bQ64511 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC50.71■■■■■ 5.71
Top2bQ64511 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC50.52■■■■■ 5.68
Top2bQ64511 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC50.51■■■■■ 5.68
Top2bQ64511 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC50.39■■■■■ 5.66
Top2bQ64511 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC50.38■■■■■ 5.66
Top2bQ64511 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.31■■■■■ 5.64
Top2bQ64511 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC50.3■■■■■ 5.64
Top2bQ64511 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC50.18■■■■■ 5.62
Top2bQ64511 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC50.1■■■■■ 5.61
Top2bQ64511 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.03■■■■■ 5.6
Top2bQ64511 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.94■■■■■ 5.58
Top2bQ64511 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC49.93■■■■■ 5.58
Top2bQ64511 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC49.93■■■■■ 5.58
Top2bQ64511 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.93■■■■■ 5.58
Top2bQ64511 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC49.87■■■■■ 5.57
Top2bQ64511 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
Top2bQ64511 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC49.8■■■■■ 5.56
Top2bQ64511 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC49.8■■■■■ 5.56
Top2bQ64511 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.77■■■■■ 5.56
Top2bQ64511 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC49.71■■■■■ 5.55
Top2bQ64511 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
Top2bQ64511 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC49.6■■■■■ 5.53
Top2bQ64511 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.53■■■■■ 5.52
Top2bQ64511 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.5■■■■■ 5.51
Top2bQ64511 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.48■■■■■ 5.51
Top2bQ64511 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC49.45■■■■■ 5.51
Top2bQ64511 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC49.35■■■■■ 5.49
Top2bQ64511 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.33■■■■■ 5.49
Top2bQ64511 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC49.33■■■■■ 5.49
Top2bQ64511 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.23■■■■■ 5.47
Top2bQ64511 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.17■■■■■ 5.46
Top2bQ64511 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
Top2bQ64511 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC49.05■■■■■ 5.44
Top2bQ64511 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.03■■■■■ 5.44
Top2bQ64511 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.99■■■■■ 5.43
Top2bQ64511 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC48.9■■■■■ 5.42
Top2bQ64511 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.82■■■■■ 5.41
Top2bQ64511 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC48.8■■■■■ 5.4
Top2bQ64511 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC48.71■■■■■ 5.39
Top2bQ64511 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.71■■■■■ 5.39
Top2bQ64511 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.69■■■■■ 5.38
Top2bQ64511 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
Top2bQ64511 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
Top2bQ64511 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.6■■■■■ 5.37
Top2bQ64511 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
Top2bQ64511 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
Top2bQ64511 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC48.54■■■■■ 5.36
Top2bQ64511 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
Top2bQ64511 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
Top2bQ64511 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC48.32■■■■■ 5.33
Top2bQ64511 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
Top2bQ64511 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
Top2bQ64511 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.21■■■■■ 5.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms