RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000157443.1

U6.1-201, mousemouse

BASIC

Gene U6, Length 101 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Synapse .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U6.1-201ENSMUST00000157443 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa3,98□□□□□ -1,77
U6.1-201ENSMUST00000157443 Chic1Q8CBW7 227 aa3,77□□□□□ -1,81
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ube2uB1AUC4 352 aa3,58□□□□□ -1,84
U6.1-201ENSMUST00000157443 Phf23Q8BSN5 401 aa3,42□□□□□ -1,86
U6.1-201ENSMUST00000157443 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP3,4□□□□□ -1,87
U6.1-201ENSMUST00000157443 CatipB9EKE5 520 aa3,37□□□□□ -1,87
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa3,19□□□□□ -1,9
U6.1-201ENSMUST00000157443 ArxO35085 564 aa3,14□□□□□ -1,91
U6.1-201ENSMUST00000157443 Gab3Q8BSM5 595 aa3,14□□□□□ -1,91
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP3,12□□□□□ -1,91
U6.1-201ENSMUST00000157443 Myt1Q8CFC2 1127 aa3,09□□□□□ -1,91
U6.1-201ENSMUST00000157443 Aplp2Q06335 707 aa3,07□□□□□ -1,92
U6.1-201ENSMUST00000157443 Rhox8Q6VSS7 320 aa3,07□□□□□ -1,92
U6.1-201ENSMUST00000157443 Vsig10D3YX43 558 aa3,06□□□□□ -1,92
U6.1-201ENSMUST00000157443 Plppr3Q7TPB0 716 aa3,03□□□□□ -1,92
U6.1-201ENSMUST00000157443 Fam163aQ8CAA5 168 aa3,03□□□□□ -1,92
U6.1-201ENSMUST00000157443 Amer1Q7TS75 1132 aa3,02□□□□□ -1,93
U6.1-201ENSMUST00000157443 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP3,02□□□□□ -1,93
U6.1-201ENSMUST00000157443 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa3□□□□□ -1,93
U6.1-201ENSMUST00000157443 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP3□□□□□ -1,93
U6.1-201ENSMUST00000157443 Taok2Q6ZQ29 1240 aa2,99□□□□□ -1,93
U6.1-201ENSMUST00000157443 Bcl11aQ9QYE3 773 aa2,98□□□□□ -1,93
U6.1-201ENSMUST00000157443 Kcna4Q61423 654 aa2,96□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ncbp3Q8BZR9 615 aaKnown RBP2,96□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 Slc4a1apE9PX68 744 aa2,95□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 Arid3aQ62431 601 aa2,94□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 Fam71e1A1L3C1 212 aa2,92□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa2,92□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 Prdm16A2A935 1275 aa2,91□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 UbtfP25976 765 aaKnown RBP2,91□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa2,91□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 BccipQ9CWI3 316 aa2,91□□□□□ -1,94
U6.1-201ENSMUST00000157443 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP2,9□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 Q8BT18 775 aa2,9□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ripply1Q2WG77 201 aa2,88□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa2,88□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 4933416C03RikQ3V063 378 aa2,87□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 Rsph4aQ8BYM7 716 aa2,87□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 Npm2Q80W85 207 aa2,86□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 CenpbP27790 599 aa2,85□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 TimelessQ9R1X4 1197 aa2,85□□□□□ -1,95
U6.1-201ENSMUST00000157443 Os9Q8K2C7 672 aa2,83□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Znf326O88291 580 aa2,82□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 GapdhsQ64467 440 aa2,82□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP2,81□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ube2q2Q8K2Z8 378 aa2,81□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa2,81□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Fbxo3Q9DC63 480 aa2,81□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 HrcG5E8J6 738 aa2,8□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP2,8□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Znf316Q6PGE4 1016 aa2,8□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Rtn4Q99P72 1162 aaKnown RBP2,8□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa2,79□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 NclP09405 707 aaKnown RBP2,79□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ecm2Q5FW85 670 aa2,79□□□□□ -1,96
U6.1-201ENSMUST00000157443 AcrbpQ3V140 540 aa2,76□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 Cnksr2Q80YA9 1032 aa2,76□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 Pcgf6Q99NA9 353 aa2,76□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 PrkcshO08795 521 aa2,75□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 Hoxd11P23813 323 aa2,75□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP2,74□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 Pde4cQ3UEI1 686 aa2,74□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP2,74□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 Pknox2Q8BG99 474 aa2,74□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 NrdcQ8BHG1 1161 aa2,74□□□□□ -1,97
U6.1-201ENSMUST00000157443 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP2,71□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Hmgb1P63158 215 aaKnown RBP2,71□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 ArsiQ32KI9 573 aa2,69□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Gtf3c3Q3TMP1 882 aa2,69□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa2,69□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP2,68□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Gm13697A2AK42 830 aa2,68□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Fgd1P52734 960 aa2,68□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP2,68□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Plcd4Q8K3R3 807 aa2,68□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Nlrp6Q91WS2 869 aa2,68□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Wdr66E9Q743 1299 aa2,67□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Hsp90b1P08113 802 aaKnown RBP2,67□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Cers3Q1A3B0 383 aa2,67□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Tshz2Q68FE9 1030 aa2,67□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Dmrt2Q8BG36 561 aa2,67□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP2,66□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 HomezQ80W88 542 aa2,66□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Slc34a2Q9DBP0 697 aa2,66□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 Irx6Q9ER75 438 aa2,66□□□□□ -1,98
U6.1-201ENSMUST00000157443 NefmP08553 848 aa2,65□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Prm3Q62100 101 aa2,65□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Znf219Q6IQX8 726 aa2,65□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Samd1D3YXK1 519 aa2,64□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ubap1lG3UW59 384 aa2,64□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Gpatch11Q3UFS4 262 aa2,64□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP2,64□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP2,64□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP2,63□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Irx3P81067 507 aa2,62□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Kiaa1211Q5PR69 1207 aa2,62□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Stag3O70576 1240 aa2,61□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 DaxxO35613 739 aa2,6□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Dnajc5P60904 198 aa2,6□□□□□ -1,99
U6.1-201ENSMUST00000157443 Ccdc9Q8VC31 543 aaKnown RBP2,6□□□□□ -1,99
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,3 ms