RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109241.4

Snx18-201, Transcript of Sorting nexin-18, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Snx18, Length 4,447 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rhox8Q6VSS7 320 aa27.47■■□□□ 1.99
Snx18-201ENSMUST00000109241 NischQ80TM9 1593 aa26.29■■□□□ 1.8
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.6■■□□□ 1.69
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
Snx18-201ENSMUST00000109241 Abcc9P70170 1546 aa24.97■■□□□ 1.59
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa24.85■■□□□ 1.57
Snx18-201ENSMUST00000109241 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.4■■□□□ 1.5
Snx18-201ENSMUST00000109241 Abcc8B2RUS7 1588 aa24.4■■□□□ 1.5
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rtl1Q7M732 1744 aa24.36■■□□□ 1.49
Snx18-201ENSMUST00000109241 Trim41Q5NCC3 630 aa24.33■■□□□ 1.48
Snx18-201ENSMUST00000109241 Zeb1Q64318 1117 aa24.32■■□□□ 1.48
Snx18-201ENSMUST00000109241 Wdr66E9Q743 1299 aa24.26■■□□□ 1.47
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.17■■□□□ 1.46
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gab3Q8BSM5 595 aa24.1■■□□□ 1.45
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa24.08■■□□□ 1.45
Snx18-201ENSMUST00000109241 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
Snx18-201ENSMUST00000109241 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.02■■□□□ 1.44
Snx18-201ENSMUST00000109241 HrcG5E8J6 738 aa24.01■■□□□ 1.43
Snx18-201ENSMUST00000109241 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.57■■□□□ 1.36
Snx18-201ENSMUST00000109241 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
Snx18-201ENSMUST00000109241 Myt1lP97500 1187 aa23.48■■□□□ 1.35
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ube2uB1AUC4 352 aa23.42■■□□□ 1.34
Snx18-201ENSMUST00000109241 NefmP08553 848 aa23.4■■□□□ 1.34
Snx18-201ENSMUST00000109241 CenpbP27790 599 aa23.39■■□□□ 1.34
Snx18-201ENSMUST00000109241 Npm2Q80W85 207 aa23.39■■□□□ 1.34
Snx18-201ENSMUST00000109241 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
Snx18-201ENSMUST00000109241 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Snx18-201ENSMUST00000109241 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa23.07■■□□□ 1.28
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Snx18-201ENSMUST00000109241 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.98■■□□□ 1.27
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa22.94■■□□□ 1.26
Snx18-201ENSMUST00000109241 Slc24a1Q91WD8 1130 aa22.91■■□□□ 1.26
Snx18-201ENSMUST00000109241 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cep164Q5DU05 1446 aa22.76■■□□□ 1.23
Snx18-201ENSMUST00000109241 Stra8P70278 393 aa22.75■■□□□ 1.23
Snx18-201ENSMUST00000109241 Amer1Q7TS75 1132 aa22.75■■□□□ 1.23
Snx18-201ENSMUST00000109241 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Snx18-201ENSMUST00000109241 Baz1aO88379 1555 aa22.68■■□□□ 1.22
Snx18-201ENSMUST00000109241 Il27Q8K3I6 234 aa22.67■■□□□ 1.22
Snx18-201ENSMUST00000109241 NacadQ5SWP3 1504 aa22.65■■□□□ 1.22
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mier1Q5UAK0 511 aa22.64■■□□□ 1.21
Snx18-201ENSMUST00000109241 Chic1Q8CBW7 227 aa22.62■■□□□ 1.21
Snx18-201ENSMUST00000109241 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.54■■□□□ 1.2
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.54■■□□□ 1.2
Snx18-201ENSMUST00000109241 Neurod1Q60867 357 aa22.45■■□□□ 1.18
Snx18-201ENSMUST00000109241 Kdm5dQ62240 1548 aa22.44■■□□□ 1.18
Snx18-201ENSMUST00000109241 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.41■■□□□ 1.18
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Snx18-201ENSMUST00000109241 NclP09405 707 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa22.38■■□□□ 1.17
Snx18-201ENSMUST00000109241 TonslQ6NZL6 1363 aa22.37■■□□□ 1.17
Snx18-201ENSMUST00000109241 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Snx18-201ENSMUST00000109241 Sall2Q9QX96 1004 aa22.22■■□□□ 1.15
Snx18-201ENSMUST00000109241 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.2■■□□□ 1.14
Snx18-201ENSMUST00000109241 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.2■■□□□ 1.14
Snx18-201ENSMUST00000109241 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.17■■□□□ 1.14
Snx18-201ENSMUST00000109241 Golga3P55937 1487 aa22.16■■□□□ 1.14
Snx18-201ENSMUST00000109241 ClspnQ80YR7 1315 aa22.14■■□□□ 1.13
Snx18-201ENSMUST00000109241 Csrnp3P59055 597 aa22.11■■□□□ 1.13
Snx18-201ENSMUST00000109241 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.11■■□□□ 1.13
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Snx18-201ENSMUST00000109241 Clip1Q922J3 1391 aa22.04■■□□□ 1.12
Snx18-201ENSMUST00000109241 ScribQ80U72 1612 aa22■■□□□ 1.11
Snx18-201ENSMUST00000109241 Anks4bQ8K3X6 423 aa22■■□□□ 1.11
Snx18-201ENSMUST00000109241 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa21.98■■□□□ 1.11
Snx18-201ENSMUST00000109241 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Snx18-201ENSMUST00000109241 Crybg2B7ZCC2 1516 aa21.92■■□□□ 1.1
Snx18-201ENSMUST00000109241 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
Snx18-201ENSMUST00000109241 Eid3Q3V124 375 aa21.91■■□□□ 1.1
Snx18-201ENSMUST00000109241 NeflP08551 543 aa21.9■■□□□ 1.1
Snx18-201ENSMUST00000109241 Lmod2Q3UHZ5 550 aa21.89■■□□□ 1.09
Snx18-201ENSMUST00000109241 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
Snx18-201ENSMUST00000109241 Sycp2Q9CUU3 1500 aa21.81■■□□□ 1.08
Snx18-201ENSMUST00000109241 Anp32aO35381 247 aa21.81■■□□□ 1.08
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.8■■□□□ 1.08
Snx18-201ENSMUST00000109241 Rtl5Q5DTT4 599 aa21.79■■□□□ 1.08
Snx18-201ENSMUST00000109241 Smarca2Q6DIC0 1577 aa21.78■■□□□ 1.08
Snx18-201ENSMUST00000109241 Aplp2Q06335 707 aa21.76■■□□□ 1.07
Snx18-201ENSMUST00000109241 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa21.63■■□□□ 1.05
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa21.6■■□□□ 1.05
Snx18-201ENSMUST00000109241 Os9Q8K2C7 672 aa21.57■■□□□ 1.04
Snx18-201ENSMUST00000109241 Setd5Q5XJV7 1441 aa21.56■■□□□ 1.04
Snx18-201ENSMUST00000109241 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Snx18-201ENSMUST00000109241 DaxxO35613 739 aa21.54■■□□□ 1.04
Snx18-201ENSMUST00000109241 CftrP26361 1476 aa21.53■■□□□ 1.04
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.51■■□□□ 1.03
Snx18-201ENSMUST00000109241 BlmO88700 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ccer2J3QPU5 274 aa21.5■■□□□ 1.03
Snx18-201ENSMUST00000109241 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.48■■□□□ 1.03
Snx18-201ENSMUST00000109241 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa21.47■■□□□ 1.03
Snx18-201ENSMUST00000109241 Fmn1Q05860 1466 aa21.46■■□□□ 1.03
Snx18-201ENSMUST00000109241 Eea1Q8BL66 1411 aa21.44■■□□□ 1.02
Snx18-201ENSMUST00000109241 Zbtb4Q5F293 982 aa21.44■■□□□ 1.02
Snx18-201ENSMUST00000109241 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa21.43■■□□□ 1.02
Snx18-201ENSMUST00000109241 Cep162Q6ZQ06 1403 aa21.43■■□□□ 1.02
Snx18-201ENSMUST00000109241 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.41■■□□□ 1.02
Snx18-201ENSMUST00000109241 Calr4Q3TQS0 420 aa21.41■■□□□ 1.02
Snx18-201ENSMUST00000109241 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.36■■□□□ 1.01
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