RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101316.9

Sh3bp2-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp2, Length 3,031 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 NischQ80TM9 1593 aa23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Abcc9P70170 1546 aa23.31■■□□□ 1.32
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Abcc8B2RUS7 1588 aa22.82■■□□□ 1.24
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Rhox8Q6VSS7 320 aa22.39■■□□□ 1.17
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Rtl1Q7M732 1744 aa22.36■■□□□ 1.17
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Dcaf1Q80TR8 1506 aa21.44■■□□□ 1.02
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa21.4■■□□□ 1.02
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 ScribQ80U72 1612 aa21.28■■□□□ 1
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa20.98■□□□□ 0.95
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Kdm5dQ62240 1548 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 HrcG5E8J6 738 aa20.88■□□□□ 0.93
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 NacadQ5SWP3 1504 aa20.82■□□□□ 0.92
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Baz1aO88379 1555 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Crybg2B7ZCC2 1516 aa20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.51■□□□□ 0.87
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Trim41Q5NCC3 630 aa20.44■□□□□ 0.86
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Sycp2Q9CUU3 1500 aa20.34■□□□□ 0.85
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Smarca2Q6DIC0 1577 aa20.3■□□□□ 0.84
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Cep164Q5DU05 1446 aa20.26■□□□□ 0.83
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Chic1Q8CBW7 227 aa19.93■□□□□ 0.78
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 BicraF8VPZ9 1578 aa19.84■□□□□ 0.77
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.76
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Gab3Q8BSM5 595 aa19.81■□□□□ 0.76
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Cngb1E1AZ71 1325 aa19.8■□□□□ 0.76
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa19.79■□□□□ 0.76
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Neurod1Q60867 357 aa19.75■□□□□ 0.75
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa19.72■□□□□ 0.75
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Zeb1Q64318 1117 aa19.7■□□□□ 0.74
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Mier1Q5UAK0 511 aa19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Golga3P55937 1487 aa19.65■□□□□ 0.74
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Synj1Q8CHC4 1574 aa19.62■□□□□ 0.73
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 NefmP08553 848 aa19.54■□□□□ 0.72
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Sall2Q9QX96 1004 aa19.51■□□□□ 0.71
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 CftrP26361 1476 aa19.5■□□□□ 0.71
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa19.48■□□□□ 0.71
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Top2bQ64511 1612 aa19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa19.22■□□□□ 0.67
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 UbtfP25976 765 aaKnown RBP19.21■□□□□ 0.67
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa19.16■□□□□ 0.66
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Anks4bQ8K3X6 423 aa19.14■□□□□ 0.65
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Csrnp3P59055 597 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Wdr66E9Q743 1299 aa19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Fmn1Q05860 1466 aa19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Cep162Q6ZQ06 1403 aa19.04■□□□□ 0.64
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa19.01■□□□□ 0.63
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 ClspnQ80YR7 1315 aa18.97■□□□□ 0.63
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Myt1lP97500 1187 aa18.95■□□□□ 0.62
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 TonslQ6NZL6 1363 aa18.84■□□□□ 0.61
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa18.83■□□□□ 0.6
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 TnnQ80Z71 1560 aa18.82■□□□□ 0.6
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Wdr62Q3U3T8 1523 aa18.81■□□□□ 0.6
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Clip1Q922J3 1391 aa18.79■□□□□ 0.6
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Frmpd1A2AKB4 1549 aa18.78■□□□□ 0.6
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Npm2Q80W85 207 aa18.75■□□□□ 0.59
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ercc6F8VPZ5 1481 aa18.72■□□□□ 0.59
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Aplp2Q06335 707 aa18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Lamc3Q9R0B6 1581 aa18.69■□□□□ 0.58
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Gm38655A0A286YDK6 273 aa18.66■□□□□ 0.58
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Arhgap35Q91YM2 1499 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Kdm5bQ80Y84 1544 aa18.65■□□□□ 0.58
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Arap1Q4LDD4 1452 aa18.64■□□□□ 0.57
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 PtprkP35822 1457 aa18.61■□□□□ 0.57
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Unc13aQ4KUS2 1712 aa18.57■□□□□ 0.56
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Eid3Q3V124 375 aa18.55■□□□□ 0.56
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 NrkQ9R0G8 1455 aa18.52■□□□□ 0.56
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa18.52■□□□□ 0.55
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Kif15Q6P9L6 1387 aa18.5■□□□□ 0.55
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Eea1Q8BL66 1411 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa18.49■□□□□ 0.55
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Camsap1A2AHC3 1581 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 CenpbP27790 599 aa18.47■□□□□ 0.55
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Ccdc18Q640L5 1455 aa18.41■□□□□ 0.54
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Setd5Q5XJV7 1441 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Shroom4Q1W617 1475 aa18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 Tiam1Q60610 1591 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.7 ms