RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040222.13

Crocc-201, Transcript of Rootletin, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Crocc, Length 6,248 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rhox8Q6VSS7 320 aa32.64■■■□□ 2.82
Crocc-201ENSMUST00000040222 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cngb1E1AZ71 1325 aa28.94■■■□□ 2.22
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa28.9■■■□□ 2.22
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
Crocc-201ENSMUST00000040222 Zeb1Q64318 1117 aa28.86■■■□□ 2.21
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ube2uB1AUC4 352 aa28.82■■■□□ 2.2
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa28.68■■■□□ 2.18
Crocc-201ENSMUST00000040222 Npm2Q80W85 207 aa28.41■■■□□ 2.14
Crocc-201ENSMUST00000040222 Gab3Q8BSM5 595 aa28.39■■■□□ 2.13
Crocc-201ENSMUST00000040222 Myt1lP97500 1187 aa28.16■■■□□ 2.1
Crocc-201ENSMUST00000040222 Wdr66E9Q743 1299 aa28.01■■■□□ 2.07
Crocc-201ENSMUST00000040222 Trim41Q5NCC3 630 aa27.78■■■□□ 2.04
Crocc-201ENSMUST00000040222 NischQ80TM9 1593 aa27.78■■■□□ 2.04
Crocc-201ENSMUST00000040222 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
Crocc-201ENSMUST00000040222 Il27Q8K3I6 234 aa27.58■■■□□ 2.01
Crocc-201ENSMUST00000040222 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
Crocc-201ENSMUST00000040222 UbtfP25976 765 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
Crocc-201ENSMUST00000040222 Amer1Q7TS75 1132 aa26.92■■□□□ 1.9
Crocc-201ENSMUST00000040222 Slc24a1Q91WD8 1130 aa26.89■■□□□ 1.89
Crocc-201ENSMUST00000040222 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa26.85■■□□□ 1.89
Crocc-201ENSMUST00000040222 Abcc9P70170 1546 aa26.79■■□□□ 1.88
Crocc-201ENSMUST00000040222 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa26.75■■□□□ 1.87
Crocc-201ENSMUST00000040222 Os9Q8K2C7 672 aa26.7■■□□□ 1.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa26.66■■□□□ 1.86
Crocc-201ENSMUST00000040222 Neurod1Q60867 357 aa26.61■■□□□ 1.85
Crocc-201ENSMUST00000040222 Plppr3Q7TPB0 716 aa26.51■■□□□ 1.83
Crocc-201ENSMUST00000040222 CenpbP27790 599 aa26.49■■□□□ 1.83
Crocc-201ENSMUST00000040222 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Crocc-201ENSMUST00000040222 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa26.47■■□□□ 1.83
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ccdc180J3QNE4 1664 aa26.45■■□□□ 1.82
Crocc-201ENSMUST00000040222 NefmP08553 848 aa26.43■■□□□ 1.82
Crocc-201ENSMUST00000040222 Gm13697A2AK42 830 aa26.39■■□□□ 1.82
Crocc-201ENSMUST00000040222 HrcG5E8J6 738 aa26.36■■□□□ 1.81
Crocc-201ENSMUST00000040222 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
Crocc-201ENSMUST00000040222 Chic1Q8CBW7 227 aa26.15■■□□□ 1.78
Crocc-201ENSMUST00000040222 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa26.1■■□□□ 1.77
Crocc-201ENSMUST00000040222 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rtl1Q7M732 1744 aa26.08■■□□□ 1.77
Crocc-201ENSMUST00000040222 Stra8P70278 393 aa26.03■■□□□ 1.76
Crocc-201ENSMUST00000040222 Pcgf6Q99NA9 353 aa25.98■■□□□ 1.75
Crocc-201ENSMUST00000040222 Atp1b4Q99ME6 356 aa25.95■■□□□ 1.75
Crocc-201ENSMUST00000040222 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
Crocc-201ENSMUST00000040222 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Crocc-201ENSMUST00000040222 NclP09405 707 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
Crocc-201ENSMUST00000040222 4930567H17RikQ3V0K5 233 aa25.92■■□□□ 1.74
Crocc-201ENSMUST00000040222 Lmod2Q3UHZ5 550 aa25.89■■□□□ 1.74
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
Crocc-201ENSMUST00000040222 NrdcQ8BHG1 1161 aa25.85■■□□□ 1.73
Crocc-201ENSMUST00000040222 Erich6D3Z6S9 713 aa25.83■■□□□ 1.73
Crocc-201ENSMUST00000040222 Gm13695A2AK44 830 aa25.81■■□□□ 1.72
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa25.81■■□□□ 1.72
Crocc-201ENSMUST00000040222 Zbtb4Q5F293 982 aa25.79■■□□□ 1.72
Crocc-201ENSMUST00000040222 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
Crocc-201ENSMUST00000040222 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa25.69■■□□□ 1.7
Crocc-201ENSMUST00000040222 4933416C03RikQ3V063 378 aa25.64■■□□□ 1.69
Crocc-201ENSMUST00000040222 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
Crocc-201ENSMUST00000040222 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
Crocc-201ENSMUST00000040222 NeflP08551 543 aa25.52■■□□□ 1.68
Crocc-201ENSMUST00000040222 Safb2Q80YR5 991 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
Crocc-201ENSMUST00000040222 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa25.38■■□□□ 1.65
Crocc-201ENSMUST00000040222 Tnnt3Q9QZ47 272 aa25.37■■□□□ 1.65
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ubl4bQ9CQ84 188 aa25.36■■□□□ 1.65
Crocc-201ENSMUST00000040222 Mier1Q5UAK0 511 aa25.33■■□□□ 1.65
Crocc-201ENSMUST00000040222 Abcc8B2RUS7 1588 aa25.32■■□□□ 1.64
Crocc-201ENSMUST00000040222 TonslQ6NZL6 1363 aa25.28■■□□□ 1.64
Crocc-201ENSMUST00000040222 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
Crocc-201ENSMUST00000040222 Myt1Q8CFC2 1127 aa25.2■■□□□ 1.62
Crocc-201ENSMUST00000040222 Nlrp6Q91WS2 869 aa25.18■■□□□ 1.62
Crocc-201ENSMUST00000040222 Polr3glQ8R0C0 218 aa25.15■■□□□ 1.62
Crocc-201ENSMUST00000040222 P3h3Q8CG70 732 aa25.01■■□□□ 1.59
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Crocc-201ENSMUST00000040222 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa24.9■■□□□ 1.58
Crocc-201ENSMUST00000040222 ClspnQ80YR7 1315 aa24.85■■□□□ 1.57
Crocc-201ENSMUST00000040222 MyclP10166 368 aa24.82■■□□□ 1.56
Crocc-201ENSMUST00000040222 Eid3Q3V124 375 aa24.76■■□□□ 1.55
Crocc-201ENSMUST00000040222 Chic2Q9D9G3 165 aa24.73■■□□□ 1.55
Crocc-201ENSMUST00000040222 Dcaf1Q80TR8 1506 aa24.72■■□□□ 1.55
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rtl5Q5DTT4 599 aa24.69■■□□□ 1.54
Crocc-201ENSMUST00000040222 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa24.68■■□□□ 1.54
Crocc-201ENSMUST00000040222 Cep164Q5DU05 1446 aa24.68■■□□□ 1.54
Crocc-201ENSMUST00000040222 ArxO35085 564 aa24.64■■□□□ 1.53
Crocc-201ENSMUST00000040222 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
Crocc-201ENSMUST00000040222 Sall2Q9QX96 1004 aa24.63■■□□□ 1.53
Crocc-201ENSMUST00000040222 Gm38655A0A286YDK6 273 aa24.62■■□□□ 1.53
Crocc-201ENSMUST00000040222 Irx6Q9ER75 438 aa24.6■■□□□ 1.53
Crocc-201ENSMUST00000040222 Anp32aO35381 247 aa24.55■■□□□ 1.52
Crocc-201ENSMUST00000040222 Clip1Q922J3 1391 aa24.54■■□□□ 1.52
Crocc-201ENSMUST00000040222 DaxxO35613 739 aa24.51■■□□□ 1.51
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa24.47■■□□□ 1.51
Crocc-201ENSMUST00000040222 Arhgap27A2AB59 869 aa24.4■■□□□ 1.5
Crocc-201ENSMUST00000040222 Csrnp3P59055 597 aa24.4■■□□□ 1.5
Crocc-201ENSMUST00000040222 NgefQ8CHT1 710 aa24.38■■□□□ 1.49
Crocc-201ENSMUST00000040222 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa24.36■■□□□ 1.49
Crocc-201ENSMUST00000040222 Anks4bQ8K3X6 423 aa24.36■■□□□ 1.49
Crocc-201ENSMUST00000040222 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Crocc-201ENSMUST00000040222 Trim26Q99PN3 545 aa24.27■■□□□ 1.48
Crocc-201ENSMUST00000040222 Clstn2Q9ER65 966 aa24.24■■□□□ 1.47
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