RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029686.3

Hcn3-201, Transcript of Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hcn3, Length 4,002 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.83■■□□□ 1.57
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa23.28■■□□□ 1.32
Hcn3-201ENSMUST00000029686 NischQ80TM9 1593 aa22.74■■□□□ 1.23
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa22.57■■□□□ 1.2
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Zeb1Q64318 1117 aa22.28■■□□□ 1.16
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Pcgf6Q99NA9 353 aa22.15■■□□□ 1.14
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Trim41Q5NCC3 630 aa22.01■■□□□ 1.11
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Gab3Q8BSM5 595 aa22■■□□□ 1.11
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Wdr66E9Q743 1299 aa21.91■■□□□ 1.1
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.76■■□□□ 1.07
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.73■■□□□ 1.07
Hcn3-201ENSMUST00000029686 HrcG5E8J6 738 aa21.51■■□□□ 1.03
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Abcc9P70170 1546 aa21.47■■□□□ 1.03
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa21.39■■□□□ 1.01
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Rtl1Q7M732 1744 aa21.34■■□□□ 1.01
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
Hcn3-201ENSMUST00000029686 UbtfP25976 765 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
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Hcn3-201ENSMUST00000029686 Neurod1Q60867 357 aa21.26■□□□□ 0.99
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Myt1lP97500 1187 aa21.23■□□□□ 0.99
Hcn3-201ENSMUST00000029686 CenpbP27790 599 aa21.13■□□□□ 0.97
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Mier1Q5UAK0 511 aa20.97■□□□□ 0.95
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Npm2Q80W85 207 aa20.94■□□□□ 0.94
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Abcc8B2RUS7 1588 aa20.92■□□□□ 0.94
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Sall2Q9QX96 1004 aa20.89■□□□□ 0.93
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Gm38655A0A286YDK6 273 aa20.88■□□□□ 0.93
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Csrnp3P59055 597 aa20.83■□□□□ 0.93
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Dcaf1Q80TR8 1506 aa20.77■□□□□ 0.92
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ube2uB1AUC4 352 aa20.72■□□□□ 0.91
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Slc24a1Q91WD8 1130 aa20.7■□□□□ 0.9
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Hcn3-201ENSMUST00000029686 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa20.54■□□□□ 0.88
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Chic1Q8CBW7 227 aa20.54■□□□□ 0.88
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Anks4bQ8K3X6 423 aa20.52■□□□□ 0.88
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
Hcn3-201ENSMUST00000029686 TonslQ6NZL6 1363 aa20.46■□□□□ 0.87
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa20.43■□□□□ 0.86
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.43■□□□□ 0.86
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa20.42■□□□□ 0.86
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Myt1Q8CFC2 1127 aa20.39■□□□□ 0.86
Hcn3-201ENSMUST00000029686 ClspnQ80YR7 1315 aa20.39■□□□□ 0.85
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa20.34■□□□□ 0.85
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.31■□□□□ 0.84
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Cep164Q5DU05 1446 aa20.3■□□□□ 0.84
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Eid3Q3V124 375 aa20.29■□□□□ 0.84
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Il27Q8K3I6 234 aa20.27■□□□□ 0.83
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Hcn3-201ENSMUST00000029686 Stra8P70278 393 aa20.22■□□□□ 0.83
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Hcn3-201ENSMUST00000029686 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Aplp2Q06335 707 aa20.2■□□□□ 0.82
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Tnnt3Q9QZ47 272 aa20.2■□□□□ 0.82
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Amer1Q7TS75 1132 aa20.18■□□□□ 0.82
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa19.99■□□□□ 0.79
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Fam71e1A1L3C1 212 aa19.92■□□□□ 0.78
Hcn3-201ENSMUST00000029686 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP19.9■□□□□ 0.78
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Lmod2Q3UHZ5 550 aa19.88■□□□□ 0.77
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Anp32aO35381 247 aa19.87■□□□□ 0.77
Hcn3-201ENSMUST00000029686 NrdcQ8BHG1 1161 aa19.82■□□□□ 0.76
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Clip1Q922J3 1391 aa19.76■□□□□ 0.75
Hcn3-201ENSMUST00000029686 4933416C03RikQ3V063 378 aa19.74■□□□□ 0.75
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Calr4Q3TQS0 420 aa19.65■□□□□ 0.74
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa19.62■□□□□ 0.73
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Bcl11aQ9QYE3 773 aa19.56■□□□□ 0.72
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Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa19.55■□□□□ 0.72
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Baz1aO88379 1555 aa19.53■□□□□ 0.72
Hcn3-201ENSMUST00000029686 P3h3Q8CG70 732 aa19.46■□□□□ 0.71
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Hcn3-201ENSMUST00000029686 DaxxO35613 739 aa19.43■□□□□ 0.7
Hcn3-201ENSMUST00000029686 NeflP08551 543 aa19.43■□□□□ 0.7
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Golga3P55937 1487 aa19.42■□□□□ 0.7
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Hcn3-201ENSMUST00000029686 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa19.35■□□□□ 0.69
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Chic2Q9D9G3 165 aa19.31■□□□□ 0.68
Hcn3-201ENSMUST00000029686 BlmO88700 1416 aa19.27■□□□□ 0.67
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Kdm5dQ62240 1548 aa19.22■□□□□ 0.67
Hcn3-201ENSMUST00000029686 ArxO35085 564 aa19.21■□□□□ 0.67
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Setd5Q5XJV7 1441 aa19.19■□□□□ 0.66
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Slc4a3P16283 1227 aa19.19■□□□□ 0.66
Hcn3-201ENSMUST00000029686 NacadQ5SWP3 1504 aa19.17■□□□□ 0.66
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Hspa5P20029 655 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Sin3aQ60520 1274 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Nolc1E9Q5C9 702 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa19.09■□□□□ 0.65
Hcn3-201ENSMUST00000029686 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
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