RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027592.5

Ubxn4-201, Transcript of UBX domain-containing protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubxn4, Length 4,113 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.97■■□□□ 1.59
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NischQ80TM9 1593 aa23.19■■□□□ 1.3
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa22.55■■□□□ 1.2
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa22.55■■□□□ 1.2
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.94■■□□□ 1.1
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Trim41Q5NCC3 630 aa21.92■■□□□ 1.1
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gab3Q8BSM5 595 aa21.83■■□□□ 1.08
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc180J3QNE4 1664 aa21.51■■□□□ 1.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zeb1Q64318 1117 aa21.49■■□□□ 1.03
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Abcc8B2RUS7 1588 aa21.41■■□□□ 1.02
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 HrcG5E8J6 738 aa21.39■■□□□ 1.01
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Wdr66E9Q743 1299 aa21.36■■□□□ 1.01
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rtl1Q7M732 1744 aa21.29■■□□□ 1
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa20.9■□□□□ 0.94
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ube2uB1AUC4 352 aa20.88■□□□□ 0.93
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.85■□□□□ 0.93
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Il27Q8K3I6 234 aa20.66■□□□□ 0.9
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa20.39■□□□□ 0.86
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Dcaf1Q80TR8 1506 aa20.37■□□□□ 0.85
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa20.35■□□□□ 0.85
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Chic1Q8CBW7 227 aa20.32■□□□□ 0.84
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cep164Q5DU05 1446 aa20.22■□□□□ 0.83
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CenpbP27790 599 aa20.21■□□□□ 0.83
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Slc24a1Q91WD8 1130 aa20.18■□□□□ 0.82
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.12■□□□□ 0.81
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 TonslQ6NZL6 1363 aa20.11■□□□□ 0.81
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Stra8P70278 393 aa20.07■□□□□ 0.8
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NclP09405 707 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Baz1aO88379 1555 aa19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NacadQ5SWP3 1504 aa19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Neurod1Q60867 357 aa19.94■□□□□ 0.78
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Lmod2Q3UHZ5 550 aa19.91■□□□□ 0.78
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sall2Q9QX96 1004 aa19.91■□□□□ 0.78
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 NrdcQ8BHG1 1161 aa19.68■□□□□ 0.74
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa19.67■□□□□ 0.74
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Golga3P55937 1487 aa19.66■□□□□ 0.74
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Anks4bQ8K3X6 423 aa19.48■□□□□ 0.71
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa19.44■□□□□ 0.7
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Gm38655A0A286YDK6 273 aa19.44■□□□□ 0.7
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa19.41■□□□□ 0.7
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Setd5Q5XJV7 1441 aa19.35■□□□□ 0.69
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Os9Q8K2C7 672 aa19.34■□□□□ 0.69
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Myt1Q8CFC2 1127 aa19.3■□□□□ 0.68
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa19.28■□□□□ 0.68
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Chic2Q9D9G3 165 aa19.27■□□□□ 0.68
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Kif15Q6P9L6 1387 aa19.24■□□□□ 0.67
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 ScribQ80U72 1612 aa19.23■□□□□ 0.67
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Amer1Q7TS75 1132 aa19.18■□□□□ 0.66
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Eea1Q8BL66 1411 aa19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Sycp2Q9CUU3 1500 aa19.15■□□□□ 0.66
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa19.14■□□□□ 0.65
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Aplp2Q06335 707 aa19.13■□□□□ 0.65
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Anp32aO35381 247 aa19.12■□□□□ 0.65
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Crybg2B7ZCC2 1516 aa19.11■□□□□ 0.65
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Smarca2Q6DIC0 1577 aa19.09■□□□□ 0.65
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Cep162Q6ZQ06 1403 aa19.06■□□□□ 0.64
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 CftrP26361 1476 aa19.04■□□□□ 0.64
Ubxn4-201ENSMUST00000027592 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa19.03■□□□□ 0.64
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Ubxn4-201ENSMUST00000027592 Calr4Q3TQS0 420 aa18.97■□□□□ 0.63
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