RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NischQ80TM9 1593 aa29.31■■■□□ 2.28
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa24.37■■□□□ 1.49
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.36■■□□□ 1.49
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Csrnp3P59055 597 aa24.15■■□□□ 1.46
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Synj1Q8CHC4 1574 aa24.13■■□□□ 1.45
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Npm2Q80W85 207 aa24.12■■□□□ 1.45
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa23.64■■□□□ 1.38
Ptprn-201ENSMUST00000027404 ClspnQ80YR7 1315 aa23.62■■□□□ 1.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TonslQ6NZL6 1363 aa23.59■■□□□ 1.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eid3Q3V124 375 aa23.59■■□□□ 1.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clip1Q922J3 1391 aa23.59■■□□□ 1.37
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa23.57■■□□□ 1.36
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep162Q6ZQ06 1403 aa23.56■■□□□ 1.36
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Top2bQ64511 1612 aa23.53■■□□□ 1.36
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fmn1Q05860 1466 aa23.44■■□□□ 1.34
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Setd5Q5XJV7 1441 aa23.12■■□□□ 1.29
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PtprkP35822 1457 aa23.08■■□□□ 1.29
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.06■■□□□ 1.28
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Eea1Q8BL66 1411 aa23.02■■□□□ 1.28
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.02■■□□□ 1.28
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Ptprn-201ENSMUST00000027404 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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