RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025786.7

Pacs1-201, Transcript of Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pacs1, Length 4,339 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Rhox8Q6VSS7 320 aa28.34■■■□□ 2.13
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa25.88■■□□□ 1.73
Pacs1-201ENSMUST00000025786 NischQ80TM9 1593 aa25.85■■□□□ 1.73
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa25.48■■□□□ 1.67
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Gab3Q8BSM5 595 aa24.86■■□□□ 1.57
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Cngb1E1AZ71 1325 aa24.84■■□□□ 1.57
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Trim41Q5NCC3 630 aa24.82■■□□□ 1.56
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Zeb1Q64318 1117 aa24.8■■□□□ 1.56
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Wdr66E9Q743 1299 aa24.68■■□□□ 1.54
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Abcc9P70170 1546 aa24.3■■□□□ 1.48
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Myt1lP97500 1187 aa24.21■■□□□ 1.47
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Npm2Q80W85 207 aa24.17■■□□□ 1.46
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.17■■□□□ 1.46
Pacs1-201ENSMUST00000025786 HrcG5E8J6 738 aa24.08■■□□□ 1.45
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ube2uB1AUC4 352 aa23.99■■□□□ 1.43
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Pcgf6Q99NA9 353 aa23.98■■□□□ 1.43
Pacs1-201ENSMUST00000025786 UbtfP25976 765 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Rtl1Q7M732 1744 aa23.96■■□□□ 1.43
Pacs1-201ENSMUST00000025786 NefmP08553 848 aa23.87■■□□□ 1.41
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Abcc8B2RUS7 1588 aa23.77■■□□□ 1.4
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
Pacs1-201ENSMUST00000025786 CenpbP27790 599 aa23.53■■□□□ 1.36
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa23.53■■□□□ 1.36
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Slc24a1Q91WD8 1130 aa23.37■■□□□ 1.33
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa23.36■■□□□ 1.33
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Il27Q8K3I6 234 aa23.35■■□□□ 1.33
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Mier1Q5UAK0 511 aa23.18■■□□□ 1.3
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa23.14■■□□□ 1.29
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Stra8P70278 393 aa23.05■■□□□ 1.28
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Fam50aQ9WV03 339 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
Pacs1-201ENSMUST00000025786 NclP09405 707 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
Pacs1-201ENSMUST00000025786 TonslQ6NZL6 1363 aa22.9■■□□□ 1.26
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Neurod1Q60867 357 aa22.86■■□□□ 1.25
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa22.77■■□□□ 1.24
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Sall2Q9QX96 1004 aa22.75■■□□□ 1.23
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Amer1Q7TS75 1132 aa22.73■■□□□ 1.23
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Chic1Q8CBW7 227 aa22.73■■□□□ 1.23
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.71■■□□□ 1.23
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Tnnt3Q9QZ47 272 aa22.69■■□□□ 1.22
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa22.68■■□□□ 1.22
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Dcaf1Q80TR8 1506 aa22.68■■□□□ 1.22
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Cep164Q5DU05 1446 aa22.63■■□□□ 1.21
Pacs1-201ENSMUST00000025786 NrdcQ8BHG1 1161 aa22.62■■□□□ 1.21
Pacs1-201ENSMUST00000025786 ClspnQ80YR7 1315 aa22.61■■□□□ 1.21
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Eid3Q3V124 375 aa22.58■■□□□ 1.21
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa22.58■■□□□ 1.21
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Gm38655A0A286YDK6 273 aa22.58■■□□□ 1.2
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Lmod2Q3UHZ5 550 aa22.56■■□□□ 1.2
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Myt1Q8CFC2 1127 aa22.49■■□□□ 1.19
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Csrnp3P59055 597 aa22.48■■□□□ 1.19
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Pacs1-201ENSMUST00000025786 NacadQ5SWP3 1504 aa22.36■■□□□ 1.17
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Anks4bQ8K3X6 423 aa22.35■■□□□ 1.17
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Clip1Q922J3 1391 aa22.29■■□□□ 1.16
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Baz1aO88379 1555 aa22.26■■□□□ 1.15
Pacs1-201ENSMUST00000025786 4933416C03RikQ3V063 378 aa22.23■■□□□ 1.15
Pacs1-201ENSMUST00000025786 NeflP08551 543 aa22.21■■□□□ 1.15
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa22.19■■□□□ 1.14
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Os9Q8K2C7 672 aa22.13■■□□□ 1.13
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Anp32aO35381 247 aa22.07■■□□□ 1.12
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Zbtb4Q5F293 982 aa22.07■■□□□ 1.12
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Aplp2Q06335 707 aa22.03■■□□□ 1.12
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Golga3P55937 1487 aa22.02■■□□□ 1.12
Pacs1-201ENSMUST00000025786 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa21.96■■□□□ 1.11
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ubl4bQ9CQ84 188 aa21.94■■□□□ 1.1
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Kdm5dQ62240 1548 aa21.94■■□□□ 1.1
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ccer2J3QPU5 274 aa21.93■■□□□ 1.1
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Rtl5Q5DTT4 599 aa21.9■■□□□ 1.1
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Hnrnpul2Q00PI9 745 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
Pacs1-201ENSMUST00000025786 DiexfQ8BTT6 772 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Chic2Q9D9G3 165 aa21.8■■□□□ 1.08
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
Pacs1-201ENSMUST00000025786 BlmO88700 1416 aa21.8■■□□□ 1.08
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Calr4Q3TQS0 420 aa21.79■■□□□ 1.08
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Setd5Q5XJV7 1441 aa21.77■■□□□ 1.08
Pacs1-201ENSMUST00000025786 DaxxO35613 739 aa21.74■■□□□ 1.07
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa21.74■■□□□ 1.07
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Prdm10Q3UTQ7 1184 aa21.74■■□□□ 1.07
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Mrs2Q5NCE8 434 aa21.71■■□□□ 1.07
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Fkbp15Q6P9Q6 1216 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa21.66■■□□□ 1.06
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.66■■□□□ 1.06
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Erich6D3Z6S9 713 aa21.64■■□□□ 1.05
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Eea1Q8BL66 1411 aa21.56■■□□□ 1.04
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Fam71e1A1L3C1 212 aa21.56■■□□□ 1.04
Pacs1-201ENSMUST00000025786 ArxO35085 564 aa21.55■■□□□ 1.04
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa21.54■■□□□ 1.04
Pacs1-201ENSMUST00000025786 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 106 ms