RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C YPL109CQ02981 657 aa3.17□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C GIS1Q03833 894 aa3.17□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C HXK1P04806 485 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C KAR2P16474 682 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C SEC20P28791 383 aa3.16□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C PRO1P32264 428 aa3.16□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C DAL4Q04895 635 aa3.16□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C PUS7Q08647 676 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C YKL222CP35995 705 aa3.16□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C ADI1Q03677 179 aa3.16□□□□□ -1.9
HDA3YPR179C SEC23P15303 768 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C YAR028WP39548 234 aa3.15□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C MTR4P47047 1073 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C YGL140CP53120 1219 aa3.15□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C RKM2Q03942 479 aa3.15□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C HDA2Q06629 674 aa3.15□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C SAM35P14693 329 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C PTC7P38797 343 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C PEX28P38848 579 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C FAA3P39002 694 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C PIC2P40035 300 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C TAF1P46677 1066 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C IPL1P38991 367 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C XKS1P42826 600 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C MRPL22P53881 309 aa3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C RSA3Q05942 220 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91 RIP-Chip
HDA3YPR179C MDL2P33311 773 aa3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C HSE1P38753 452 aa3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C GIP4P39732 760 aa3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C RIM8P53179 542 aa3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C PEX13P80667 386 aa3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C TPP1Q03796 238 aa3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C OXR1Q08952 273 aa3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C YDL177CQ12257 170 aa3.13□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C SOD2P00447 233 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C SRO9P25567 434 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C AFG2P32794 780 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C FLR1P38124 548 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C GTS1P40956 396 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C HRK1Q08732 759 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C LAP2Q10740 671 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C TAF13P11747 167 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C RPT1P33299 467 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C SQT1P35184 431 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C ADD66P36040 267 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C YHL012WP38709 493 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C RSM26P47141 266 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C ENV11P53246 860 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C YGR122WP53272 402 aa3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C RRP15Q06511 250 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C AIM3P38266 947 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C QNS1P38795 714 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C GNP1P48813 663 aa3.11□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C FOL2P51601 243 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C SNO2P53823 222 aa3.11□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C PRE9P23638 258 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C BAP2P38084 609 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C THI12P42883 340 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C THI5P43534 340 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C VPS53P47061 822 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C YJR107WP47145 328 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C ENT3P47160 408 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C THI11P47183 340 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C THI13Q07748 340 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C MCD1Q12158 566 aa3.1□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C HXT13P39924 564 aa3.09□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C YJL045WP47052 634 aa3.09□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C HXT17P53631 564 aa3.09□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C HXT15P54854 567 aa3.09□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C EST2Q06163 884 aa3.09□□□□□ -1.91
HDA3YPR179C RPS13P05756 151 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RAD2P07276 1031 aa3.09□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C CYC8P14922 966 aa3.09□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C ATE1P16639 503 aa3.09□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C YSC84P32793 468 aa3.09□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C ETP1P38748 585 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C YPL277CQ08989 487 aa3.09□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C ATG14P38270 344 aa3.08□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C NMD3P38861 518 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SIW14P53965 281 aa3.08□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C GSF2Q04697 403 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RSC58Q07979 502 aa3.08□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SLD2P34252 453 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C MRPS18P42847 217 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C YNR063WP53749 607 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C YML020WQ03722 664 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C NBA1Q08229 501 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C YLR358CO13565 187 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C SNF5P18480 905 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data3.07□□□□□ -1.92not detected
HDA3YPR179C KIP1P28742 1111 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C TOD6P34219 525 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C RPN3P40016 523 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C HNT2P49775 206 aa3.07□□□□□ -1.92
HDA3YPR179C MKK2P32491 506 aa3.06□□□□□ -1.92
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