RNA–Protein interactions for RNA: YPL060C-A

YPL060C-A, Transcript of TyA Gag protein, yeastyeast

Gene YPL060C-A, Length 3,315 nt, Biotype pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPL060C-AYPL060C-A INP54Q08227 384 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A NOP1P15646 327 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A PYC2P32327 1180 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A RFC5P38251 354 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YAP1801P38856 637 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A QDR1P40475 563 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SKP1P52286 194 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YGR045CP53229 120 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A MEC3Q02574 474 aa1.3□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A RPS31P05759 152 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A IOC3P43596 787 aa1.29□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SGD1Q06132 899 aa1.29□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A EST2Q06163 884 aa1.29□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SCT1P32784 759 aa1.29□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A CTH1P47976 325 aa1.29□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YML083CQ04526 418 aa1.29□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A VPS53P47061 822 aa1.28□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A YPL277CQ08989 487 aa1.28□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A TIF6Q12522 245 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A CYC1P00044 109 aaPredicted RBP1.28□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data1.28□□□□□ -2.2not detected
YPL060C-AYPL060C-A SPO11P23179 398 aa1.28□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A GCV1P48015 400 aa1.28□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SPO20Q04359 397 aa1.28□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SVS1Q12254 260 aa1.28□□□□□ -2.2
YPL060C-AYPL060C-A SPC29P33419 253 aa1.28□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A HIS7P33734 552 aaKnown RBP1.28□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A MET3P08536 511 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A UBP1P25037 809 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A TRM2P33753 639 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A ZRG8P40021 1076 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A NTA1P40354 457 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A MAD1P40957 749 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A MRX10Q05648 414 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A PGM1P33401 570 aaKnown RBP1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SUL1P38359 859 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A YJL045WP47052 634 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A MSE1P48525 536 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A CAB1Q04430 367 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A GLO4Q12320 285 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A YBL113CQ7M4S9 792 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A APL6P46682 809 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A ALD3P54114 506 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A GPB1Q08886 897 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A YVC1Q12324 675 aa1.27□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A HRR25P29295 494 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A POL5P39985 1022 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A MRPS18P42847 217 aa1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A NCE103P53615 221 aa1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SVF1Q05515 481 aa1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A EMG1Q06287 252 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SNF2P22082 1703 aa1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A THS1P04801 734 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A PFK1P16861 987 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A ORM2Q06144 216 aa1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A HBT1Q07653 1046 aaKnown RBP1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A RCL1Q08096 367 aaPredicted RBP1.26□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A HCA4P20448 770 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A FLR1P38124 548 aa1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A HXT5P38695 592 aa1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A RVS167P39743 482 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A PEX28P38848 579 aa1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A BFA1P47113 574 aa1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A HNT2P49775 206 aa1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A BIO5P53744 561 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A GIS1Q03833 894 aa1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SSA1P10591 642 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A PTP1P25044 335 aa1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A YCS4Q06156 1176 aa1.25□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SEC15P22224 910 aa1.24□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A NGG1P32494 702 aa1.24□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A BOI1P38041 980 aaKnown RBP1.24□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A LAM1P38851 1228 aa1.24□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SLS1P42900 643 aa1.24□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP1.24□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A GAL10P04397 699 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A KIN3P22209 435 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A RPC31P17890 251 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A PUP1P25043 261 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SRO9P25567 434 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A GLO1P50107 326 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A MNN10P50108 393 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A HOS3Q02959 697 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SED4P25365 1065 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A COX18P53239 316 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A YNL011CP53980 444 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SIZ1Q04195 904 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A RSA3Q05942 220 aaKnown RBP1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A RSC58Q07979 502 aa1.23□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A HTS1P07263 546 aaKnown RBP1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A CTS1P29029 562 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A MRPL9P31334 269 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A AAR2P32357 355 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A OYE3P41816 400 aaPredicted RBP1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A YAF9P53930 226 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A RLF2Q12495 606 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A SOD2P00447 233 aa1.22□□□□□ -2.21
YPL060C-AYPL060C-A BAS1P22035 811 aa1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 89.4 ms