RNA–Protein interactions for RNA: YOL137W

BSC6, Transcript of Protein of unknown function with 8 putative transmembrane segments, yeast

Gene BSC6, Length 1,494 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BSC6	YOL137W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	15.06	■□□□□ 0
BSC6	YOL137W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	15.06	■□□□□ 0
BSC6	YOL137W	MET6	P05694	767 aa	Known RBP	15.05	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	MSH3	P25336	1018 aa		15.05	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	RTT107	P38850	1070 aa		15.05	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	HKR1	P41809	1802 aa		15.05	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	15.04	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	15.04	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	RAD61	Q99359	647 aa		15.04	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	FLO1	P32768	1537 aa		15.04	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	HIS4	P00815	799 aa	Known RBP	15.03	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	ALG1	P16661	449 aa		15.03	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	STE11	P23561	717 aa		15.03	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	ALF1	P53904	254 aa		15.03	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	CRF1	Q04930	467 aa		15.03	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	YOR296W	Q08748	1289 aa		15.03	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	CSR2	Q12734	1121 aa		15.03	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	SNF3	P10870	884 aa		15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	YET1	P35723	206 aa		15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	LYS14	P40971	790 aa		15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	PIP2	P52960	996 aa		15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	YGL138C	P53122	345 aa		15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	PSF3	Q12146	194 aa		15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	TIP41	Q12199	356 aa		15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	MCM16	Q12262	181 aa		15.02	■□□□□ -0
BSC6	YOL137W	SEC65	P29478	273 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	HIR1	P32479	840 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	BCD1	P38772	366 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	VID27	P40157	782 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	RTC4	P53850	401 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	VPS38	Q05919	439 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	CAJ1	P39101	391 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	YGR237C	P50089	785 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	TOS4	Q06266	489 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	PSR2	Q07949	397 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	YPL260W	Q08977	551 aa		15.01	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	15	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	15	□□□□□ -0.01	not detected
BSC6	YOL137W	DAK2	P43550	591 aa		15	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	UBX2	Q04228	584 aa		15	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	GIS4	Q04233	774 aa		15	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	CCC2	P38995	1004 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	JJJ2	P46997	583 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	VPS4	P52917	437 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	ATG9	Q12142	997 aa		14.99	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	CTM1	P38818	585 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	SEC9	P40357	651 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	LSC2	P53312	427 aa		14.98	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	SPT8	P38915	602 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	14.97	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	HMI1	Q12039	706 aa		14.97	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	CIT1	P00890	479 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	14.96	□□□□□ -0.01	not detected
BSC6	YOL137W	SPO11	P23179	398 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	DPB3	P27344	201 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	NSG2	P53898	299 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	YOL098C	Q12496	1037 aa		14.96	□□□□□ -0.01
BSC6	YOL137W	EFM2	P38347	419 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	NDC80	P40460	691 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	SML1	Q04964	104 aa		14.95	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	MYO1	P08964	1928 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	MAL13	P53338	473 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	RBA50	Q04418	439 aa		14.94	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	UTP13	Q05946	817 aa	Known RBP	14.94	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	PSO2	P30620	661 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	ERG5	P54781	538 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	14.93	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		14.93	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	VPS8	P39702	1274 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	RAD26	P40352	1085 aa		14.92	□□□□□ -0.02
BSC6	YOL137W	APL6	P46682	809 aa		14.92	□□□□□ -0.02

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