RNA–Protein interactions for RNA: YMR254C

YMR254C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YMR254C, Length 309 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR254C	YMR254C	MAG2	Q06436	670 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	RAD2	P07276	1031 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	HSE1	P38753	452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	MRPS18	P42847	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	RCM1	P53972	490 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	RMD1	Q03441	430 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	BRE4	Q07660	1125 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	NSI1	Q12457	570 aa		5.05	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	HEM13	P11353	328 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	ADD66	P36040	267 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	XKS1	P42826	600 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	LAP2	Q10740	671 aa		5.04	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	ORC3	P54790	616 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	YVC1	Q12324	675 aa		5.03	□□□□□ -1.6
YMR254C	YMR254C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	VPS53	P47061	822 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	EAR1	Q03212	550 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	ATG14	P38270	344 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	PEX7	P39108	375 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	RPS26A	P39938	119 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	RPS26B	P39939	119 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	SIW14	P53965	281 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	EST2	Q06163	884 aa		5.01	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	LIP5	P32875	414 aa		5	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	GNP1	P48813	663 aa		5	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	TRE1	Q08919	783 aa		5	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	FYV10	P40492	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	HDA2	Q06629	674 aa		4.99	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	SAM35	P14693	329 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	AFG2	P32794	780 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	SEC8	P32855	1065 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	HXT13	P39924	564 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	HXT17	P53631	564 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	HXT15	P54854	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	TPP1	Q03796	238 aa		4.98	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	ADP1	P25371	1049 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	MCM2	P29469	868 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	MDL2	P33311	773 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	SEA4	P38164	1038 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	SDH1	Q00711	640 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	SPR28	Q04921	423 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR254C	YMR254C	ELM1	P32801	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	ECL1	P48235	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	GCR1	P07261	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	BAP2	P38084	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	YHL012W	P38709	493 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	SSY1	Q03770	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	AOS1	Q06624	347 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	RTT10	Q08924	1013 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	LPX1	Q12405	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	MKK2	P32491	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	YSC84	P32793	468 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	MNR2	P35724	969 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	ALG3	P38179	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	RGD1	P38339	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	YJL045W	P47052	634 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	YNR063W	P53749	607 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	ROD1	Q02805	837 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	PTC5	Q12511	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	KIP1	P28742	1111 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	PRO1	P32264	428 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	HSP78	P33416	811 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	SVF1	Q05515	481 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	MRL1	Q06815	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	DFG16	Q99234	619 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	NAP1	P25293	417 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	NIT1	P40447	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	IRC24	P40580	263 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	ENV11	P53246	860 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	RAD27	P26793	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	PTC7	P38797	343 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	MET10	P39692	1035 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	CNN1	P43618	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	TNA1	P53322	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YMR254C	YMR254C	COQ4	O13525	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR254C	YMR254C	CDC34	P14682	295 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR254C	YMR254C	SNF5	P18480	905 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR254C	YMR254C	PEP7	P32609	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR254C	YMR254C	DUT1	P33317	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR254C	YMR254C	LRG1	P35688	1017 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YMR254C	YMR254C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13.3 ms