RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccne1Q61457 408 aa18.85■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kdm6aO70546 1401 aa18.85■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Plin1Q8CGN5 517 aa18.84■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BcorQ8CGN4 1759 aa18.84■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MyclP10166 368 aa18.83■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mre11Q61216 706 aa18.83■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ric3Q8BPM6 367 aa18.83■□□□□ 0.61
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Map7O88735 730 aa18.83■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif18aQ91WD7 886 aa18.83■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tm6sf1P58749 370 aa18.82■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif2s2Q99L45 331 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr17E9Q271 1322 aa18.82■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prim1P20664 417 aa18.81■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim27Q62158 513 aa18.81■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cetn4Q8K4K1 168 aa18.81■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gimap6Q8K349 305 aa18.8■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hsp90ab1P11499 724 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HypkQ9CR41 129 aa18.8■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aifm3Q3TY86 605 aa18.8■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ggnbp2Q5SV77 696 aa18.79■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Snap23O09044 210 aa18.79■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TimelessQ9R1X4 1197 aa18.79■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rtf1A2AQ19 715 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aldh8a1Q8BH00 487 aa18.78■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pnpla7A2AJ88 1352 aa18.78■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem132eQ6IEE6 982 aa18.77■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abcc12Q80WJ6 1366 aa18.77■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atf5O70191 283 aa18.77■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kif2cQ922S8 721 aa18.77■□□□□ 0.6
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sptbn5F6UCX4 1208 aa18.76■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rabep1O35551 862 aa18.76■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gsdma3Q5Y4Y6 464 aa18.76■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcnh5Q920E3 988 aa18.76■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rangap1P46061 589 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Amotl1Q9D4H4 968 aa18.76■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CarsQ9ER72 831 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr63B2RY71 923 aa18.75■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cog6Q8R3I3 657 aa18.74■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FocadA2AKG8 1798 aa18.74■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TnrQ8BYI9 1358 aa18.73■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cgnl1Q6AW69 1298 aa18.72■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnks1bp1P58871 1720 aa18.72■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fyb1O35601 819 aa18.72■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abca15E9PWH4 1668 aa18.71■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcna6Q61923 529 aa18.71■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam13aQ8BGI4 693 aa18.71■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slain2Q8CI08 581 aa18.71■□□□□ 0.59
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa18.71■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnajc5P60904 198 aa18.7■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp1r37Q8BKR5 712 aa18.7■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sv2bQ8BG39 683 aa18.7■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TatQ8QZR1 454 aa18.69■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gcc1Q9D4H2 778 aa18.69■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aox2Q5SGK3 1345 aa18.69■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Bcl9lQ67FY2 1494 aa18.68■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pdlim2Q8R1G6 349 aa18.68■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prkar2bP31324 416 aa18.68■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dnajc10Q9DC23 793 aa18.68■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Simc1E9Q6E9 1354 aa18.68■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scn4aQ9ER60 1841 aa18.68■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mcm2P97310 904 aa18.67■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Aplp1Q03157 653 aa18.67■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Amotl2Q8K371 772 aa18.67■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fmnl2A2APV2 1086 aa18.67■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa18.66■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cnksr1A2A9K7 700 aa18.66■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam83gQ5SWY7 812 aa18.66■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa18.66■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pibf1E9Q6K3 756 aa18.66■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Disp3A3KFU9 1347 aa18.65■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mfap1aC0HKD8 439 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mfap1bC0HKD9 439 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col15a1O35206 1367 aa18.65■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Stk36Q69ZM6 1316 aa18.65■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Triml2E9PW10 424 aa18.64■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 FanclQ9CR14 375 aa18.64■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CenppQ9CZ92 286 aa18.64■□□□□ 0.58
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10093D3YYI8 482 aa18.64■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Chpf2Q3UU43 768 aa18.63■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ltbp4Q8K4G1 1666 aa18.63■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa18.63■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CoilQ5SU73 570 aa18.62■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Farp2Q91VS8 1065 aa18.62■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col1a2Q01149 1372 aa18.62■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anapc15-psA0A140T8L6 141 aa18.62■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cyp2d11P24457 504 aa18.62■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nkx2-3P97334 362 aa18.62■□□□□ 0.57
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MlecQ6ZQI3 291 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.3 ms