RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000055506.8

Gtf3c1-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c1, Length 6,961 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prkd3Q8K1Y2 889 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cpt1bQ924X2 772 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mat2bQ99LB6 334 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ropn1Q9ESG2 212 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mta2Q9R190 668 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 XdhQ00519 1335 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lipo4D3Z608 396 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Inpp5aE9QAS7 422 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Alas2P08680 587 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gnao1P18872 354 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Igfbp1P47876 272 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ChatQ03059 641 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Srbd1Q497V5 1015 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ipcef1Q5DU31 406 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Chst10Q6PGK7 356 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pcdh18Q8VHR0 1134 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ubxn6Q99PL6 442 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ndufb5Q9CQH3 189 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rfc5Q9D0F6 339 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Inpp4aQ9EPW0 939 aa11.13□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Atxn2lQ7TQH0 1049 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pcid2Q8BFV2 399 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Arf2Q8BSL7 181 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Setdb2Q8C267 713 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Amigo3Q8C2S7 508 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr826Q8VFU6 313 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr825Q8VFU7 320 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 VillQ91YD6 859 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Prdm9Q96EQ9 843 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 EcdQ9CS74 641 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Adgra3Q7TT36 1310 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 JhyE9Q793 770 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ptar1E9QAB6 424 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Mcpt4P21812 246 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gnb5P62881 395 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gdpd4Q3TT99 632 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Opa3Q505D7 179 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 AbrQ5SSL4 859 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc26a2Q62273 739 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ints6Q6PCM2 883 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pcsk9Q80W65 694 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ahsa1Q8BK64 338 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aqp12Q8CHJ2 290 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 PhykplQ8R1K4 467 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aspscr1Q8VBT9 550 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dlg2Q91XM9 852 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cyp2j9Q924D1 502 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Znf639Q99KZ6 485 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 S100a14Q9D2Q8 104 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ssc5dQ8BV57 1371 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Med14A2ABV5 1459 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm13089A2AGW7 455 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 A930018M24RikB7ZMY3 218 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gm20695H3BLK7 282 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gja1P23242 382 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sox8Q04886 464 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slfn4Q3UV66 602 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tgoln2Q62314 363 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 ParpbpQ6IRT3 573 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr389Q7TRX7 312 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Trit1Q80UN9 467 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Tbx10Q810F8 385 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Igdcc3Q8BQC3 813 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 OlahQ8R197 265 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Usp26Q99MX1 835 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Myg1Q9JK81 380 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Ildr2B5TVM2 661 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 MarcoQ60754 518 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r26Q6TAC4 855 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stk40Q7TNL3 435 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Thap1Q8CHW1 210 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Gramd1cQ8CI52 457 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Fabp12Q9DAK4 132 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aox3G3X982 1335 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1145A2AVC7 325 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zbtb10E9Q8X5 861 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Arfip1G5E8V9 373 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cyp4a10O88833 509 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Pax7P47239 503 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Rad9bQ6WBX7 403 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 NarsQ8BP47 559 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cacul1Q8R0X2 377 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Olfr1090Q8VGA6 313 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Slc25a36Q922G0 311 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cyp4f13Q99N19 523 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Clk4O35493 481 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Lgals7O54974 136 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dnmt3aO88508 908 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Emilin3P59900 758 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Sema3cQ62181 751 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Dpy19l3Q71B07 716 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Aoc1Q8JZQ5 751 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Cdhr1Q8VHP6 859 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Stoml2Q99JB2 353 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Yaf2Q99LW6 179 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Commd8Q9CZG3 183 aa11.12□□□□□ -0.63
Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 Zbtb32Q9JKD9 465 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.8 ms