Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB6

Mat2b, Methionine adenosyltransferase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mat2bQ99LB6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
Mat2bQ99LB6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Mat2bQ99LB6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Mat2bQ99LB6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Mat2bQ99LB6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Mat2bQ99LB6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Mat2bQ99LB6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Mat2bQ99LB6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Mat2bQ99LB6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Mat2bQ99LB6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Mat2bQ99LB6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Mat2bQ99LB6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Mat2bQ99LB6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Mat2bQ99LB6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Mat2bQ99LB6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Mat2bQ99LB6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Mat2bQ99LB6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Mat2bQ99LB6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Mat2bQ99LB6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Mat2bQ99LB6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Mat2bQ99LB6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Mat2bQ99LB6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Mat2bQ99LB6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Mat2bQ99LB6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Mat2bQ99LB6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Mat2bQ99LB6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Mat2bQ99LB6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Mat2bQ99LB6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mat2bQ99LB6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Mat2bQ99LB6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Mat2bQ99LB6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Mat2bQ99LB6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Mat2bQ99LB6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Mat2bQ99LB6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Mat2bQ99LB6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Mat2bQ99LB6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Mat2bQ99LB6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Mat2bQ99LB6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Mat2bQ99LB6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Mat2bQ99LB6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Mat2bQ99LB6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Mat2bQ99LB6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Mat2bQ99LB6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Mat2bQ99LB6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Mat2bQ99LB6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Mat2bQ99LB6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Mat2bQ99LB6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Mat2bQ99LB6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mat2bQ99LB6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Mat2bQ99LB6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Mat2bQ99LB6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Mat2bQ99LB6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Mat2bQ99LB6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Mat2bQ99LB6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Mat2bQ99LB6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Mat2bQ99LB6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Mat2bQ99LB6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Mat2bQ99LB6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Mat2bQ99LB6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Mat2bQ99LB6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mat2bQ99LB6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Mat2bQ99LB6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Mat2bQ99LB6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Mat2bQ99LB6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Mat2bQ99LB6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Mat2bQ99LB6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Mat2bQ99LB6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mat2bQ99LB6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Mat2bQ99LB6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mat2bQ99LB6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Mat2bQ99LB6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mat2bQ99LB6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mat2bQ99LB6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mat2bQ99LB6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Mat2bQ99LB6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mat2bQ99LB6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mat2bQ99LB6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mat2bQ99LB6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mat2bQ99LB6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mat2bQ99LB6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mat2bQ99LB6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Mat2bQ99LB6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mat2bQ99LB6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Mat2bQ99LB6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mat2bQ99LB6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mat2bQ99LB6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mat2bQ99LB6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Mat2bQ99LB6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Mat2bQ99LB6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Mat2bQ99LB6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Mat2bQ99LB6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Mat2bQ99LB6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Mat2bQ99LB6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Mat2bQ99LB6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Mat2bQ99LB6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Mat2bQ99LB6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Mat2bQ99LB6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Mat2bQ99LB6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Mat2bQ99LB6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Mat2bQ99LB6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms