Protein–RNA interactions for Protein: P08680

Alas2, 5-aminolevulinate synthase, erythroid-specific, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alas2P08680 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Alas2P08680 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Alas2P08680 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Alas2P08680 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Alas2P08680 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Alas2P08680 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Alas2P08680 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Alas2P08680 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Alas2P08680 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Alas2P08680 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Alas2P08680 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Alas2P08680 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Alas2P08680 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Alas2P08680 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Alas2P08680 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Alas2P08680 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Alas2P08680 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Alas2P08680 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Alas2P08680 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
Alas2P08680 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Alas2P08680 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Alas2P08680 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Alas2P08680 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Alas2P08680 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Alas2P08680 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Alas2P08680 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Alas2P08680 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Alas2P08680 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Alas2P08680 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Alas2P08680 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Alas2P08680 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Alas2P08680 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Alas2P08680 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Alas2P08680 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Alas2P08680 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Alas2P08680 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Alas2P08680 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Alas2P08680 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Alas2P08680 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Alas2P08680 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Alas2P08680 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Alas2P08680 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Alas2P08680 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Alas2P08680 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Alas2P08680 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Alas2P08680 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Alas2P08680 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Alas2P08680 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Alas2P08680 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Alas2P08680 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Alas2P08680 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Alas2P08680 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Alas2P08680 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Alas2P08680 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Alas2P08680 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Alas2P08680 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Alas2P08680 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Alas2P08680 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Alas2P08680 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Alas2P08680 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Alas2P08680 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Alas2P08680 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Alas2P08680 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alas2P08680 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Alas2P08680 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alas2P08680 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Alas2P08680 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Alas2P08680 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Alas2P08680 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Alas2P08680 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Alas2P08680 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Alas2P08680 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Alas2P08680 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Alas2P08680 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Alas2P08680 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Alas2P08680 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Alas2P08680 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Alas2P08680 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Alas2P08680 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Alas2P08680 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Alas2P08680 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Alas2P08680 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Alas2P08680 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Alas2P08680 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Alas2P08680 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Alas2P08680 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Alas2P08680 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alas2P08680 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Alas2P08680 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Alas2P08680 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Alas2P08680 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Alas2P08680 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alas2P08680 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Alas2P08680 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Alas2P08680 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Alas2P08680 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Alas2P08680 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Alas2P08680 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Alas2P08680 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Alas2P08680 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms