Protein–RNA interactions for Protein: Q99LW6

Yaf2, YY1-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yaf2Q99LW6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
Yaf2Q99LW6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Yaf2Q99LW6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Yaf2Q99LW6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Yaf2Q99LW6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Yaf2Q99LW6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Yaf2Q99LW6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Yaf2Q99LW6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Yaf2Q99LW6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Yaf2Q99LW6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Yaf2Q99LW6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Yaf2Q99LW6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Yaf2Q99LW6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Yaf2Q99LW6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
Yaf2Q99LW6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Yaf2Q99LW6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Yaf2Q99LW6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Yaf2Q99LW6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Yaf2Q99LW6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Yaf2Q99LW6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Yaf2Q99LW6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Yaf2Q99LW6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Yaf2Q99LW6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Yaf2Q99LW6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Yaf2Q99LW6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Yaf2Q99LW6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Yaf2Q99LW6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Yaf2Q99LW6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Yaf2Q99LW6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Yaf2Q99LW6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Yaf2Q99LW6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Yaf2Q99LW6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
Yaf2Q99LW6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Yaf2Q99LW6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
Yaf2Q99LW6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Yaf2Q99LW6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Yaf2Q99LW6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Yaf2Q99LW6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Yaf2Q99LW6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Yaf2Q99LW6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
Yaf2Q99LW6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Yaf2Q99LW6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Yaf2Q99LW6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Yaf2Q99LW6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Yaf2Q99LW6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Yaf2Q99LW6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Yaf2Q99LW6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Yaf2Q99LW6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Yaf2Q99LW6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Yaf2Q99LW6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Yaf2Q99LW6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Yaf2Q99LW6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Yaf2Q99LW6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Yaf2Q99LW6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Yaf2Q99LW6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Yaf2Q99LW6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Yaf2Q99LW6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Yaf2Q99LW6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Yaf2Q99LW6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Yaf2Q99LW6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Yaf2Q99LW6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Yaf2Q99LW6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Yaf2Q99LW6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Yaf2Q99LW6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Yaf2Q99LW6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Yaf2Q99LW6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Yaf2Q99LW6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Yaf2Q99LW6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Yaf2Q99LW6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Yaf2Q99LW6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Yaf2Q99LW6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Yaf2Q99LW6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Yaf2Q99LW6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Yaf2Q99LW6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Yaf2Q99LW6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Yaf2Q99LW6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Yaf2Q99LW6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Yaf2Q99LW6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Yaf2Q99LW6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Yaf2Q99LW6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Yaf2Q99LW6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Yaf2Q99LW6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Yaf2Q99LW6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Yaf2Q99LW6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Yaf2Q99LW6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Yaf2Q99LW6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Yaf2Q99LW6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Yaf2Q99LW6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Yaf2Q99LW6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Yaf2Q99LW6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Yaf2Q99LW6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Yaf2Q99LW6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Yaf2Q99LW6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Yaf2Q99LW6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Yaf2Q99LW6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Yaf2Q99LW6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Yaf2Q99LW6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Yaf2Q99LW6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Yaf2Q99LW6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Yaf2Q99LW6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms