Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,33■■■■□ 3,09
Ropn1Q9ESG2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,16■■■□□ 2,9
Ropn1Q9ESG2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,99■■■□□ 2,87
Ropn1Q9ESG2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32,34■■■□□ 2,77
Ropn1Q9ESG2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,28■■■□□ 2,76
Ropn1Q9ESG2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Ropn1Q9ESG2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Ropn1Q9ESG2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,25■■■□□ 2,59
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Ropn1Q9ESG2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Ropn1Q9ESG2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,82■■■□□ 2,53
Ropn1Q9ESG2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,73■■■□□ 2,51
Ropn1Q9ESG2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Ropn1Q9ESG2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,45■■■□□ 2,46
Ropn1Q9ESG2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Ropn1Q9ESG2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,34■■■□□ 2,45
Ropn1Q9ESG2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Ropn1Q9ESG2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Ropn1Q9ESG2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ropn1Q9ESG2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ropn1Q9ESG2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ropn1Q9ESG2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ropn1Q9ESG2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Ropn1Q9ESG2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29,44■■■□□ 2,3
Ropn1Q9ESG2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ropn1Q9ESG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Ropn1Q9ESG2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,23■■■□□ 2,27
Ropn1Q9ESG2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,13■■■□□ 2,25
Ropn1Q9ESG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Ropn1Q9ESG2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Ropn1Q9ESG2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,06■■■□□ 2,24
Ropn1Q9ESG2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,06■■■□□ 2,24
Ropn1Q9ESG2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ropn1Q9ESG2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,05■■■□□ 2,24
Ropn1Q9ESG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ropn1Q9ESG2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Ropn1Q9ESG2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,02■■■□□ 2,24
Ropn1Q9ESG2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,01■■■□□ 2,23
Ropn1Q9ESG2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Ropn1Q9ESG2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Ropn1Q9ESG2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Ropn1Q9ESG2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Ropn1Q9ESG2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
Ropn1Q9ESG2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Ropn1Q9ESG2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Ropn1Q9ESG2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,71■■■□□ 2,19
Ropn1Q9ESG2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
Ropn1Q9ESG2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Ropn1Q9ESG2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28,58■■■□□ 2,17
Ropn1Q9ESG2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Ropn1Q9ESG2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Ropn1Q9ESG2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Ropn1Q9ESG2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Ropn1Q9ESG2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Ropn1Q9ESG2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Ropn1Q9ESG2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Ropn1Q9ESG2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ropn1Q9ESG2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ropn1Q9ESG2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Ropn1Q9ESG2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ropn1Q9ESG2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Ropn1Q9ESG2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Ropn1Q9ESG2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,99■■■□□ 2,07
Ropn1Q9ESG2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27,96■■■□□ 2,07
Ropn1Q9ESG2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Ropn1Q9ESG2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Ropn1Q9ESG2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Ropn1Q9ESG2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ropn1Q9ESG2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ropn1Q9ESG2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Ropn1Q9ESG2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Ropn1Q9ESG2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Ropn1Q9ESG2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Ropn1Q9ESG2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27,61■■■□□ 2,01
Ropn1Q9ESG2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ropn1Q9ESG2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Ropn1Q9ESG2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,54■■■□□ 2
Ropn1Q9ESG2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ropn1Q9ESG2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,44■■□□□ 1,98
Ropn1Q9ESG2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Ropn1Q9ESG2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ropn1Q9ESG2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ropn1Q9ESG2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ropn1Q9ESG2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ropn1Q9ESG2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ropn1Q9ESG2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,33■■□□□ 1,97
Ropn1Q9ESG2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ropn1Q9ESG2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,3■■□□□ 1,96
Ropn1Q9ESG2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Ropn1Q9ESG2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ropn1Q9ESG2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Ropn1Q9ESG2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Ropn1Q9ESG2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ropn1Q9ESG2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Ropn1Q9ESG2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ropn1Q9ESG2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ropn1Q9ESG2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ropn1Q9ESG2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ropn1Q9ESG2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ropn1Q9ESG2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms