Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSL7

Arf2, ADP-ribosylation factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf2Q8BSL7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,62■■■□□ 2,81
Arf2Q8BSL7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Arf2Q8BSL7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Arf2Q8BSL7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Arf2Q8BSL7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Arf2Q8BSL7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,11■■■□□ 2,25
Arf2Q8BSL7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,89■■■□□ 2,22
Arf2Q8BSL7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Arf2Q8BSL7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Arf2Q8BSL7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Arf2Q8BSL7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Arf2Q8BSL7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,88■■■□□ 2,05
Arf2Q8BSL7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,61■■■□□ 2,01
Arf2Q8BSL7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Arf2Q8BSL7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Arf2Q8BSL7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,49■■□□□ 1,99
Arf2Q8BSL7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,29■■□□□ 1,96
Arf2Q8BSL7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Arf2Q8BSL7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Arf2Q8BSL7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Arf2Q8BSL7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Arf2Q8BSL7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Arf2Q8BSL7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Arf2Q8BSL7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Arf2Q8BSL7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Arf2Q8BSL7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Arf2Q8BSL7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Arf2Q8BSL7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,89■■□□□ 1,9
Arf2Q8BSL7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Arf2Q8BSL7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Arf2Q8BSL7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Arf2Q8BSL7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Arf2Q8BSL7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,58■■□□□ 1,84
Arf2Q8BSL7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Arf2Q8BSL7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Arf2Q8BSL7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Arf2Q8BSL7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Arf2Q8BSL7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Arf2Q8BSL7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Arf2Q8BSL7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Arf2Q8BSL7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Arf2Q8BSL7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Arf2Q8BSL7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Arf2Q8BSL7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Arf2Q8BSL7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Arf2Q8BSL7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Arf2Q8BSL7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Arf2Q8BSL7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Arf2Q8BSL7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Arf2Q8BSL7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Arf2Q8BSL7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,69■■□□□ 1,7
Arf2Q8BSL7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Arf2Q8BSL7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Arf2Q8BSL7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,62■■□□□ 1,69
Arf2Q8BSL7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Arf2Q8BSL7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Arf2Q8BSL7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Arf2Q8BSL7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Arf2Q8BSL7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Arf2Q8BSL7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Arf2Q8BSL7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Arf2Q8BSL7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Arf2Q8BSL7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Arf2Q8BSL7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Arf2Q8BSL7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,31■■□□□ 1,64
Arf2Q8BSL7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Arf2Q8BSL7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Arf2Q8BSL7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,27■■□□□ 1,64
Arf2Q8BSL7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Arf2Q8BSL7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Arf2Q8BSL7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,2■■□□□ 1,63
Arf2Q8BSL7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Arf2Q8BSL7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Arf2Q8BSL7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Arf2Q8BSL7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Arf2Q8BSL7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Arf2Q8BSL7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Arf2Q8BSL7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,94■■□□□ 1,58
Arf2Q8BSL7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Arf2Q8BSL7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Arf2Q8BSL7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Arf2Q8BSL7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Arf2Q8BSL7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Arf2Q8BSL7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Arf2Q8BSL7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Arf2Q8BSL7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Arf2Q8BSL7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Arf2Q8BSL7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Arf2Q8BSL7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Arf2Q8BSL7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,71■■□□□ 1,55
Arf2Q8BSL7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24,66■■□□□ 1,54
Arf2Q8BSL7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,66■■□□□ 1,54
Arf2Q8BSL7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,64■■□□□ 1,54
Arf2Q8BSL7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Arf2Q8BSL7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Arf2Q8BSL7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Arf2Q8BSL7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Arf2Q8BSL7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Arf2Q8BSL7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Arf2Q8BSL7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,6 ms