Protein–RNA interactions for Protein: P62881

Gnb5, Guanine nucleotide-binding protein subunit beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb5P62881 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34,26■■■■□ 3,08
Gnb5P62881 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Gnb5P62881 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,23■■■□□ 2,59
Gnb5P62881 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Gnb5P62881 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Gnb5P62881 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Gnb5P62881 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Gnb5P62881 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Gnb5P62881 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,49■■■□□ 2,31
Gnb5P62881 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,26
Gnb5P62881 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29,01■■■□□ 2,24
Gnb5P62881 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
Gnb5P62881 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Gnb5P62881 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Gnb5P62881 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28,64■■■□□ 2,18
Gnb5P62881 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Gnb5P62881 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Gnb5P62881 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Gnb5P62881 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,12
Gnb5P62881 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Gnb5P62881 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Gnb5P62881 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Gnb5P62881 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Gnb5P62881 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Gnb5P62881 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Gnb5P62881 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Gnb5P62881 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Gnb5P62881 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Gnb5P62881 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27,78■■■□□ 2,04
Gnb5P62881 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Gnb5P62881 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Gnb5P62881 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Gnb5P62881 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,69■■■□□ 2,02
Gnb5P62881 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27,65■■■□□ 2,02
Gnb5P62881 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Gnb5P62881 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Gnb5P62881 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Gnb5P62881 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27,28■■□□□ 1,96
Gnb5P62881 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Gnb5P62881 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Gnb5P62881 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gnb5P62881 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Gnb5P62881 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Gnb5P62881 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Gnb5P62881 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Gnb5P62881 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Gnb5P62881 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26,97■■□□□ 1,91
Gnb5P62881 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Gnb5P62881 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Gnb5P62881 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
Gnb5P62881 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Gnb5P62881 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Gnb5P62881 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Gnb5P62881 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Gnb5P62881 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Gnb5P62881 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,57■■□□□ 1,84
Gnb5P62881 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Gnb5P62881 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Gnb5P62881 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Gnb5P62881 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Gnb5P62881 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,44■■□□□ 1,82
Gnb5P62881 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Gnb5P62881 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Gnb5P62881 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Gnb5P62881 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Gnb5P62881 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Gnb5P62881 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Gnb5P62881 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Gnb5P62881 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Gnb5P62881 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Gnb5P62881 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Gnb5P62881 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Gnb5P62881 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Gnb5P62881 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26,06■■□□□ 1,76
Gnb5P62881 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gnb5P62881 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Gnb5P62881 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Gnb5P62881 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Gnb5P62881 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Gnb5P62881 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Gnb5P62881 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Gnb5P62881 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Gnb5P62881 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Gnb5P62881 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Gnb5P62881 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25,82■■□□□ 1,72
Gnb5P62881 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Gnb5P62881 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Gnb5P62881 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Gnb5P62881 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Gnb5P62881 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Gnb5P62881 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Gnb5P62881 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Gnb5P62881 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gnb5P62881 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Gnb5P62881 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Gnb5P62881 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gnb5P62881 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Gnb5P62881 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Gnb5P62881 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Gnb5P62881 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,4 ms