Protein–RNA interactions for Protein: Q03059

Chat, Choline O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChatQ03059 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
ChatQ03059 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ChatQ03059 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
ChatQ03059 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ChatQ03059 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
ChatQ03059 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ChatQ03059 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ChatQ03059 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ChatQ03059 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ChatQ03059 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ChatQ03059 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
ChatQ03059 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
ChatQ03059 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ChatQ03059 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ChatQ03059 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ChatQ03059 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
ChatQ03059 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
ChatQ03059 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ChatQ03059 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ChatQ03059 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ChatQ03059 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ChatQ03059 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ChatQ03059 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ChatQ03059 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ChatQ03059 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ChatQ03059 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ChatQ03059 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
ChatQ03059 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ChatQ03059 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ChatQ03059 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ChatQ03059 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ChatQ03059 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ChatQ03059 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ChatQ03059 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ChatQ03059 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ChatQ03059 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ChatQ03059 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ChatQ03059 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ChatQ03059 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ChatQ03059 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
ChatQ03059 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ChatQ03059 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ChatQ03059 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ChatQ03059 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ChatQ03059 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ChatQ03059 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ChatQ03059 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ChatQ03059 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ChatQ03059 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ChatQ03059 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ChatQ03059 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ChatQ03059 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ChatQ03059 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ChatQ03059 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ChatQ03059 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ChatQ03059 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ChatQ03059 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ChatQ03059 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ChatQ03059 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ChatQ03059 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ChatQ03059 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ChatQ03059 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ChatQ03059 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ChatQ03059 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ChatQ03059 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ChatQ03059 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ChatQ03059 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ChatQ03059 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ChatQ03059 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ChatQ03059 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ChatQ03059 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ChatQ03059 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ChatQ03059 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ChatQ03059 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
ChatQ03059 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ChatQ03059 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ChatQ03059 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ChatQ03059 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ChatQ03059 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ChatQ03059 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ChatQ03059 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ChatQ03059 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ChatQ03059 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ChatQ03059 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ChatQ03059 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ChatQ03059 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ChatQ03059 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ChatQ03059 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ChatQ03059 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ChatQ03059 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ChatQ03059 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ChatQ03059 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ChatQ03059 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChatQ03059 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ChatQ03059 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ChatQ03059 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ChatQ03059 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ChatQ03059 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ChatQ03059 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ChatQ03059 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms