Protein–RNA interactions for Protein: Q9R190

Mta2, Metastasis-associated protein MTA2, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mta2Q9R190 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC37,7■■■■□ 3,63
Mta2Q9R190 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Mta2Q9R190 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Mta2Q9R190 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,27■■■■□ 3,24
Mta2Q9R190 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34,47■■■■□ 3,11
Mta2Q9R190 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,09■■■■□ 3,05
Mta2Q9R190 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,05■■■■□ 3,04
Mta2Q9R190 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,75■■■□□ 2,99
Mta2Q9R190 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,71■■■□□ 2,99
Mta2Q9R190 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Mta2Q9R190 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,15■■■□□ 2,9
Mta2Q9R190 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,1■■■□□ 2,89
Mta2Q9R190 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Mta2Q9R190 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Mta2Q9R190 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
Mta2Q9R190 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,62■■■□□ 2,81
Mta2Q9R190 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,6■■■□□ 2,81
Mta2Q9R190 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
Mta2Q9R190 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
Mta2Q9R190 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC32,36■■■□□ 2,77
Mta2Q9R190 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,77
Mta2Q9R190 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Mta2Q9R190 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
Mta2Q9R190 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
Mta2Q9R190 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Mta2Q9R190 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32,07■■■□□ 2,72
Mta2Q9R190 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Mta2Q9R190 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,96■■■□□ 2,71
Mta2Q9R190 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,78■■■□□ 2,68
Mta2Q9R190 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31,77■■■□□ 2,68
Mta2Q9R190 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,74■■■□□ 2,67
Mta2Q9R190 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Mta2Q9R190 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Mta2Q9R190 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC31,58■■■□□ 2,65
Mta2Q9R190 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Mta2Q9R190 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Mta2Q9R190 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Mta2Q9R190 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Mta2Q9R190 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,39■■■□□ 2,62
Mta2Q9R190 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31,26■■■□□ 2,59
Mta2Q9R190 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31,25■■■□□ 2,59
Mta2Q9R190 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31,22■■■□□ 2,59
Mta2Q9R190 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Mta2Q9R190 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,13■■■□□ 2,57
Mta2Q9R190 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31,08■■■□□ 2,57
Mta2Q9R190 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Mta2Q9R190 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Mta2Q9R190 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC30,96■■■□□ 2,55
Mta2Q9R190 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30,95■■■□□ 2,55
Mta2Q9R190 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
Mta2Q9R190 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,68■■■□□ 2,5
Mta2Q9R190 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,55■■■□□ 2,48
Mta2Q9R190 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Mta2Q9R190 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,32■■■□□ 2,44
Mta2Q9R190 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Mta2Q9R190 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Mta2Q9R190 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,3■■■□□ 2,44
Mta2Q9R190 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Mta2Q9R190 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,18■■■□□ 2,42
Mta2Q9R190 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Mta2Q9R190 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Mta2Q9R190 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Mta2Q9R190 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Mta2Q9R190 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Mta2Q9R190 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Mta2Q9R190 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Mta2Q9R190 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Mta2Q9R190 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Mta2Q9R190 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Mta2Q9R190 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Mta2Q9R190 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Mta2Q9R190 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Mta2Q9R190 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Mta2Q9R190 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Mta2Q9R190 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Mta2Q9R190 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Mta2Q9R190 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Mta2Q9R190 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Mta2Q9R190 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Mta2Q9R190 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Mta2Q9R190 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Mta2Q9R190 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Mta2Q9R190 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Mta2Q9R190 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29,52■■■□□ 2,32
Mta2Q9R190 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Mta2Q9R190 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Mta2Q9R190 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Mta2Q9R190 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Mta2Q9R190 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Mta2Q9R190 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Mta2Q9R190 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29,37■■■□□ 2,29
Mta2Q9R190 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,36■■■□□ 2,29
Mta2Q9R190 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Mta2Q9R190 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Mta2Q9R190 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Mta2Q9R190 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Mta2Q9R190 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Mta2Q9R190 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Mta2Q9R190 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Mta2Q9R190 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40,4 ms