Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC40.49■■■■■ 4.07
Sox8Q04886 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Sox8Q04886 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Sox8Q04886 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Sox8Q04886 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Sox8Q04886 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Sox8Q04886 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Sox8Q04886 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Sox8Q04886 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Sox8Q04886 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Sox8Q04886 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Sox8Q04886 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sox8Q04886 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Sox8Q04886 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sox8Q04886 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Sox8Q04886 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Sox8Q04886 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Sox8Q04886 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Sox8Q04886 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Sox8Q04886 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Sox8Q04886 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sox8Q04886 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Sox8Q04886 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sox8Q04886 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sox8Q04886 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sox8Q04886 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Sox8Q04886 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sox8Q04886 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Sox8Q04886 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sox8Q04886 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sox8Q04886 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sox8Q04886 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Sox8Q04886 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Sox8Q04886 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sox8Q04886 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sox8Q04886 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
Sox8Q04886 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Sox8Q04886 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Sox8Q04886 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sox8Q04886 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sox8Q04886 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Sox8Q04886 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sox8Q04886 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Sox8Q04886 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sox8Q04886 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Sox8Q04886 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sox8Q04886 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Sox8Q04886 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sox8Q04886 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Sox8Q04886 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Sox8Q04886 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Sox8Q04886 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Sox8Q04886 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Sox8Q04886 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Sox8Q04886 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sox8Q04886 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Sox8Q04886 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sox8Q04886 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Sox8Q04886 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Sox8Q04886 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Sox8Q04886 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sox8Q04886 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Sox8Q04886 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Sox8Q04886 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Sox8Q04886 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Sox8Q04886 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Sox8Q04886 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sox8Q04886 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sox8Q04886 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sox8Q04886 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sox8Q04886 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sox8Q04886 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sox8Q04886 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sox8Q04886 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Sox8Q04886 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sox8Q04886 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Sox8Q04886 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Sox8Q04886 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sox8Q04886 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sox8Q04886 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Sox8Q04886 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sox8Q04886 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sox8Q04886 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sox8Q04886 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sox8Q04886 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sox8Q04886 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sox8Q04886 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sox8Q04886 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Sox8Q04886 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sox8Q04886 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Sox8Q04886 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Sox8Q04886 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sox8Q04886 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sox8Q04886 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sox8Q04886 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Sox8Q04886 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Sox8Q04886 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sox8Q04886 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sox8Q04886 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sox8Q04886 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms