Protein–RNA interactions for Protein: Q00519

Xdh, Xanthine dehydrogenase/oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XdhQ00519 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45,87■■■■■ 4,93
XdhQ00519 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
XdhQ00519 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,85■■■■■ 4,29
XdhQ00519 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39,9■■■■□ 3,98
XdhQ00519 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39,87■■■■□ 3,97
XdhQ00519 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39,02■■■■□ 3,84
XdhQ00519 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
XdhQ00519 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,7■■■■□ 3,79
XdhQ00519 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
XdhQ00519 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38,25■■■■□ 3,71
XdhQ00519 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
XdhQ00519 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
XdhQ00519 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
XdhQ00519 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
XdhQ00519 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37,21■■■■□ 3,55
XdhQ00519 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36,94■■■■□ 3,5
XdhQ00519 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,92■■■■□ 3,5
XdhQ00519 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36,84■■■■□ 3,49
XdhQ00519 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,81■■■■□ 3,48
XdhQ00519 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
XdhQ00519 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,51■■■■□ 3,43
XdhQ00519 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,44■■■■□ 3,42
XdhQ00519 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
XdhQ00519 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36,36■■■■□ 3,41
XdhQ00519 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,35■■■■□ 3,41
XdhQ00519 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,32■■■■□ 3,4
XdhQ00519 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36,3■■■■□ 3,4
XdhQ00519 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,29■■■■□ 3,4
XdhQ00519 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36,24■■■■□ 3,39
XdhQ00519 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,07■■■■□ 3,37
XdhQ00519 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
XdhQ00519 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
XdhQ00519 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35,74■■■■□ 3,31
XdhQ00519 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35,58■■■■□ 3,29
XdhQ00519 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
XdhQ00519 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
XdhQ00519 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
XdhQ00519 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35,24■■■■□ 3,23
XdhQ00519 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,2■■■■□ 3,23
XdhQ00519 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
XdhQ00519 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
XdhQ00519 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35,13■■■■□ 3,21
XdhQ00519 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34,93■■■■□ 3,18
XdhQ00519 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34,92■■■■□ 3,18
XdhQ00519 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34,9■■■■□ 3,18
XdhQ00519 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34,81■■■■□ 3,16
XdhQ00519 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34,81■■■■□ 3,16
XdhQ00519 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,73■■■■□ 3,15
XdhQ00519 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,49■■■■□ 3,11
XdhQ00519 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
XdhQ00519 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34,42■■■■□ 3,1
XdhQ00519 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34,34■■■■□ 3,09
XdhQ00519 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34,32■■■■□ 3,09
XdhQ00519 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,31■■■■□ 3,08
XdhQ00519 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34,28■■■■□ 3,08
XdhQ00519 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34,22■■■■□ 3,07
XdhQ00519 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,2■■■■□ 3,06
XdhQ00519 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34,17■■■■□ 3,06
XdhQ00519 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,15■■■■□ 3,06
XdhQ00519 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
XdhQ00519 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34,05■■■■□ 3,04
XdhQ00519 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
XdhQ00519 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34,03■■■■□ 3,04
XdhQ00519 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34,02■■■■□ 3,04
XdhQ00519 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34,01■■■■□ 3,03
XdhQ00519 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3,03
XdhQ00519 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,96■■■■□ 3,03
XdhQ00519 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,92■■■■□ 3,02
XdhQ00519 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
XdhQ00519 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
XdhQ00519 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33,84■■■■□ 3,01
XdhQ00519 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33,82■■■■□ 3,01
XdhQ00519 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33,8■■■■□ 3
XdhQ00519 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
XdhQ00519 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,7■■■□□ 2,99
XdhQ00519 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
XdhQ00519 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33,68■■■□□ 2,98
XdhQ00519 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,67■■■□□ 2,98
XdhQ00519 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33,61■■■□□ 2,97
XdhQ00519 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
XdhQ00519 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33,57■■■□□ 2,96
XdhQ00519 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,52■■■□□ 2,96
XdhQ00519 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
XdhQ00519 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33,46■■■□□ 2,95
XdhQ00519 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,46■■■□□ 2,95
XdhQ00519 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33,43■■■□□ 2,94
XdhQ00519 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33,41■■■□□ 2,94
XdhQ00519 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
XdhQ00519 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
XdhQ00519 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33,26■■■□□ 2,91
XdhQ00519 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
XdhQ00519 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
XdhQ00519 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
XdhQ00519 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33,18■■■□□ 2,9
XdhQ00519 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
XdhQ00519 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,13■■■□□ 2,89
XdhQ00519 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
XdhQ00519 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
XdhQ00519 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
XdhQ00519 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33■■■□□ 2,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms