Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC43.76■■■■■ 4.6
Usp26Q99MX1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Usp26Q99MX1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Usp26Q99MX1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Usp26Q99MX1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
Usp26Q99MX1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
Usp26Q99MX1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Usp26Q99MX1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Usp26Q99MX1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Usp26Q99MX1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Usp26Q99MX1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Usp26Q99MX1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
Usp26Q99MX1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Usp26Q99MX1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Usp26Q99MX1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Usp26Q99MX1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Usp26Q99MX1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Usp26Q99MX1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Usp26Q99MX1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Usp26Q99MX1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Usp26Q99MX1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Usp26Q99MX1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Usp26Q99MX1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Usp26Q99MX1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Usp26Q99MX1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Usp26Q99MX1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Usp26Q99MX1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Usp26Q99MX1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Usp26Q99MX1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Usp26Q99MX1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Usp26Q99MX1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Usp26Q99MX1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Usp26Q99MX1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Usp26Q99MX1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Usp26Q99MX1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Usp26Q99MX1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Usp26Q99MX1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Usp26Q99MX1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Usp26Q99MX1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Usp26Q99MX1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Usp26Q99MX1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Usp26Q99MX1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Usp26Q99MX1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Usp26Q99MX1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Usp26Q99MX1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Usp26Q99MX1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Usp26Q99MX1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Usp26Q99MX1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Usp26Q99MX1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Usp26Q99MX1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Usp26Q99MX1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Usp26Q99MX1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Usp26Q99MX1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Usp26Q99MX1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp26Q99MX1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Usp26Q99MX1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Usp26Q99MX1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Usp26Q99MX1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Usp26Q99MX1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Usp26Q99MX1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Usp26Q99MX1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Usp26Q99MX1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Usp26Q99MX1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Usp26Q99MX1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Usp26Q99MX1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Usp26Q99MX1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Usp26Q99MX1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Usp26Q99MX1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Usp26Q99MX1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Usp26Q99MX1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Usp26Q99MX1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Usp26Q99MX1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Usp26Q99MX1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp26Q99MX1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Usp26Q99MX1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Usp26Q99MX1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Usp26Q99MX1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Usp26Q99MX1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Usp26Q99MX1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Usp26Q99MX1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Usp26Q99MX1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Usp26Q99MX1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Usp26Q99MX1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Usp26Q99MX1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Usp26Q99MX1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Usp26Q99MX1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Usp26Q99MX1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Usp26Q99MX1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Usp26Q99MX1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Usp26Q99MX1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp26Q99MX1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp26Q99MX1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Usp26Q99MX1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Usp26Q99MX1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp26Q99MX1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Usp26Q99MX1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Usp26Q99MX1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Usp26Q99MX1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
Usp26Q99MX1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Usp26Q99MX1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
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