Protein–RNA interactions for Protein: P47876

Igfbp1, Insulin-like growth factor-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp1P47876 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Igfbp1P47876 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Igfbp1P47876 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC26,78■■□□□ 1,88
Igfbp1P47876 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Igfbp1P47876 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,36■■□□□ 1,81
Igfbp1P47876 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
Igfbp1P47876 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Igfbp1P47876 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Igfbp1P47876 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Igfbp1P47876 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24,77■■□□□ 1,56
Igfbp1P47876 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Igfbp1P47876 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Igfbp1P47876 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Igfbp1P47876 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,59■■□□□ 1,53
Igfbp1P47876 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Igfbp1P47876 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Igfbp1P47876 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Igfbp1P47876 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Igfbp1P47876 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Igfbp1P47876 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Igfbp1P47876 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Igfbp1P47876 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
Igfbp1P47876 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Igfbp1P47876 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,24■■□□□ 1,47
Igfbp1P47876 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Igfbp1P47876 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,97■■□□□ 1,43
Igfbp1P47876 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Igfbp1P47876 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,93■■□□□ 1,42
Igfbp1P47876 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23,86■■□□□ 1,41
Igfbp1P47876 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
Igfbp1P47876 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Igfbp1P47876 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Igfbp1P47876 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Igfbp1P47876 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Igfbp1P47876 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Igfbp1P47876 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Igfbp1P47876 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23,43■■□□□ 1,34
Igfbp1P47876 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23,4■■□□□ 1,34
Igfbp1P47876 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Igfbp1P47876 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Igfbp1P47876 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Igfbp1P47876 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Igfbp1P47876 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Igfbp1P47876 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Igfbp1P47876 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Igfbp1P47876 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,17■■□□□ 1,3
Igfbp1P47876 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Igfbp1P47876 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Igfbp1P47876 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,02■■□□□ 1,28
Igfbp1P47876 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Igfbp1P47876 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Igfbp1P47876 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Igfbp1P47876 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,91■■□□□ 1,26
Igfbp1P47876 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Igfbp1P47876 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Igfbp1P47876 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Igfbp1P47876 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Igfbp1P47876 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Igfbp1P47876 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Igfbp1P47876 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,83■■□□□ 1,25
Igfbp1P47876 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Igfbp1P47876 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Igfbp1P47876 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Igfbp1P47876 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Igfbp1P47876 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Igfbp1P47876 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Igfbp1P47876 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,59■■□□□ 1,21
Igfbp1P47876 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Igfbp1P47876 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Igfbp1P47876 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22,52■■□□□ 1,2
Igfbp1P47876 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,49■■□□□ 1,19
Igfbp1P47876 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Igfbp1P47876 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Igfbp1P47876 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Igfbp1P47876 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Igfbp1P47876 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Igfbp1P47876 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Igfbp1P47876 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Igfbp1P47876 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,17
Igfbp1P47876 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC22,33■■□□□ 1,17
Igfbp1P47876 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
Igfbp1P47876 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Igfbp1P47876 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Igfbp1P47876 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22,31■■□□□ 1,16
Igfbp1P47876 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
Igfbp1P47876 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Igfbp1P47876 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Igfbp1P47876 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Igfbp1P47876 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Igfbp1P47876 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Igfbp1P47876 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Igfbp1P47876 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Igfbp1P47876 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Igfbp1P47876 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22,2■■□□□ 1,15
Igfbp1P47876 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Igfbp1P47876 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Igfbp1P47876 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Igfbp1P47876 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Igfbp1P47876 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Igfbp1P47876 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms