Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
Sema3cQ62181 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Sema3cQ62181 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Sema3cQ62181 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Sema3cQ62181 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
Sema3cQ62181 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Sema3cQ62181 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Sema3cQ62181 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Sema3cQ62181 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
Sema3cQ62181 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sema3cQ62181 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Sema3cQ62181 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Sema3cQ62181 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Sema3cQ62181 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sema3cQ62181 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Sema3cQ62181 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Sema3cQ62181 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Sema3cQ62181 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sema3cQ62181 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sema3cQ62181 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sema3cQ62181 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Sema3cQ62181 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Sema3cQ62181 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sema3cQ62181 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sema3cQ62181 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sema3cQ62181 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sema3cQ62181 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
Sema3cQ62181 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Sema3cQ62181 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
Sema3cQ62181 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Sema3cQ62181 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Sema3cQ62181 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Sema3cQ62181 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Sema3cQ62181 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Sema3cQ62181 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Sema3cQ62181 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Sema3cQ62181 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Sema3cQ62181 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Sema3cQ62181 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Sema3cQ62181 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Sema3cQ62181 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Sema3cQ62181 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Sema3cQ62181 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Sema3cQ62181 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Sema3cQ62181 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sema3cQ62181 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sema3cQ62181 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sema3cQ62181 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sema3cQ62181 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sema3cQ62181 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Sema3cQ62181 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sema3cQ62181 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sema3cQ62181 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sema3cQ62181 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Sema3cQ62181 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sema3cQ62181 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sema3cQ62181 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Sema3cQ62181 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sema3cQ62181 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sema3cQ62181 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Sema3cQ62181 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Sema3cQ62181 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Sema3cQ62181 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sema3cQ62181 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Sema3cQ62181 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sema3cQ62181 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sema3cQ62181 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sema3cQ62181 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sema3cQ62181 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sema3cQ62181 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sema3cQ62181 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sema3cQ62181 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sema3cQ62181 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sema3cQ62181 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Sema3cQ62181 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sema3cQ62181 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Sema3cQ62181 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sema3cQ62181 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sema3cQ62181 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sema3cQ62181 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sema3cQ62181 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema3cQ62181 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sema3cQ62181 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Sema3cQ62181 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Sema3cQ62181 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Sema3cQ62181 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Sema3cQ62181 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Sema3cQ62181 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Sema3cQ62181 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sema3cQ62181 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Sema3cQ62181 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Sema3cQ62181 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Sema3cQ62181 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Sema3cQ62181 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Sema3cQ62181 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sema3cQ62181 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Sema3cQ62181 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sema3cQ62181 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sema3cQ62181 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sema3cQ62181 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms