Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Pax7P47239 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Pax7P47239 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Pax7P47239 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Pax7P47239 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Pax7P47239 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Pax7P47239 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Pax7P47239 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Pax7P47239 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pax7P47239 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pax7P47239 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pax7P47239 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pax7P47239 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pax7P47239 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pax7P47239 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Pax7P47239 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pax7P47239 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pax7P47239 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pax7P47239 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Pax7P47239 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pax7P47239 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pax7P47239 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pax7P47239 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pax7P47239 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Pax7P47239 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Pax7P47239 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Pax7P47239 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Pax7P47239 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pax7P47239 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pax7P47239 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Pax7P47239 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pax7P47239 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pax7P47239 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Pax7P47239 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pax7P47239 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pax7P47239 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pax7P47239 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pax7P47239 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pax7P47239 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pax7P47239 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Pax7P47239 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pax7P47239 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pax7P47239 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pax7P47239 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pax7P47239 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pax7P47239 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pax7P47239 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pax7P47239 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pax7P47239 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pax7P47239 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pax7P47239 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pax7P47239 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pax7P47239 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pax7P47239 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pax7P47239 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pax7P47239 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pax7P47239 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pax7P47239 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pax7P47239 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pax7P47239 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pax7P47239 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pax7P47239 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pax7P47239 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pax7P47239 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pax7P47239 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pax7P47239 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pax7P47239 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pax7P47239 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pax7P47239 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pax7P47239 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pax7P47239 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pax7P47239 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pax7P47239 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pax7P47239 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pax7P47239 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Pax7P47239 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Pax7P47239 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pax7P47239 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pax7P47239 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pax7P47239 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Pax7P47239 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Pax7P47239 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Pax7P47239 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Pax7P47239 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Pax7P47239 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Pax7P47239 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Pax7P47239 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pax7P47239 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pax7P47239 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pax7P47239 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Pax7P47239 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pax7P47239 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pax7P47239 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pax7P47239 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pax7P47239 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pax7P47239 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pax7P47239 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pax7P47239 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pax7P47239 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pax7P47239 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.3 ms