Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
Gja1P23242 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Gja1P23242 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Gja1P23242 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Gja1P23242 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Gja1P23242 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gja1P23242 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Gja1P23242 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Gja1P23242 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Gja1P23242 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Gja1P23242 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Gja1P23242 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Gja1P23242 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Gja1P23242 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Gja1P23242 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gja1P23242 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Gja1P23242 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Gja1P23242 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gja1P23242 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gja1P23242 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Gja1P23242 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gja1P23242 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Gja1P23242 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gja1P23242 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Gja1P23242 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Gja1P23242 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gja1P23242 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gja1P23242 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Gja1P23242 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Gja1P23242 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Gja1P23242 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Gja1P23242 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gja1P23242 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Gja1P23242 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gja1P23242 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Gja1P23242 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
Gja1P23242 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gja1P23242 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gja1P23242 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gja1P23242 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gja1P23242 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Gja1P23242 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gja1P23242 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Gja1P23242 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Gja1P23242 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Gja1P23242 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gja1P23242 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Gja1P23242 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gja1P23242 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Gja1P23242 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gja1P23242 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja1P23242 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Gja1P23242 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Gja1P23242 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Gja1P23242 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Gja1P23242 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gja1P23242 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gja1P23242 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gja1P23242 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gja1P23242 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Gja1P23242 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gja1P23242 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Gja1P23242 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gja1P23242 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gja1P23242 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Gja1P23242 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gja1P23242 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Gja1P23242 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Gja1P23242 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja1P23242 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja1P23242 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Gja1P23242 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Gja1P23242 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Gja1P23242 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gja1P23242 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Gja1P23242 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Gja1P23242 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Gja1P23242 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Gja1P23242 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gja1P23242 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Gja1P23242 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gja1P23242 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gja1P23242 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gja1P23242 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja1P23242 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja1P23242 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja1P23242 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gja1P23242 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Gja1P23242 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gja1P23242 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gja1P23242 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gja1P23242 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gja1P23242 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gja1P23242 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gja1P23242 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gja1P23242 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Gja1P23242 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Gja1P23242 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gja1P23242 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gja1P23242 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.1 ms