Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS74

Ecd, Protein ecdysoneless homolog, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EcdQ9CS74 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
EcdQ9CS74 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EcdQ9CS74 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
EcdQ9CS74 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
EcdQ9CS74 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
EcdQ9CS74 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
EcdQ9CS74 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
EcdQ9CS74 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
EcdQ9CS74 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EcdQ9CS74 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EcdQ9CS74 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
EcdQ9CS74 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
EcdQ9CS74 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EcdQ9CS74 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EcdQ9CS74 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EcdQ9CS74 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EcdQ9CS74 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
EcdQ9CS74 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EcdQ9CS74 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EcdQ9CS74 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EcdQ9CS74 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EcdQ9CS74 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EcdQ9CS74 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EcdQ9CS74 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EcdQ9CS74 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
EcdQ9CS74 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
EcdQ9CS74 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
EcdQ9CS74 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
EcdQ9CS74 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
EcdQ9CS74 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
EcdQ9CS74 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
EcdQ9CS74 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
EcdQ9CS74 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
EcdQ9CS74 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
EcdQ9CS74 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
EcdQ9CS74 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EcdQ9CS74 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EcdQ9CS74 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EcdQ9CS74 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EcdQ9CS74 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EcdQ9CS74 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
EcdQ9CS74 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EcdQ9CS74 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EcdQ9CS74 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EcdQ9CS74 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EcdQ9CS74 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EcdQ9CS74 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EcdQ9CS74 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EcdQ9CS74 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EcdQ9CS74 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EcdQ9CS74 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EcdQ9CS74 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
EcdQ9CS74 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EcdQ9CS74 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EcdQ9CS74 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EcdQ9CS74 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EcdQ9CS74 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EcdQ9CS74 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EcdQ9CS74 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EcdQ9CS74 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EcdQ9CS74 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EcdQ9CS74 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EcdQ9CS74 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EcdQ9CS74 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EcdQ9CS74 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EcdQ9CS74 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EcdQ9CS74 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EcdQ9CS74 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EcdQ9CS74 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EcdQ9CS74 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EcdQ9CS74 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EcdQ9CS74 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EcdQ9CS74 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EcdQ9CS74 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
EcdQ9CS74 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EcdQ9CS74 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EcdQ9CS74 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EcdQ9CS74 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EcdQ9CS74 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EcdQ9CS74 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EcdQ9CS74 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EcdQ9CS74 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EcdQ9CS74 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EcdQ9CS74 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EcdQ9CS74 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EcdQ9CS74 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EcdQ9CS74 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EcdQ9CS74 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EcdQ9CS74 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EcdQ9CS74 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EcdQ9CS74 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EcdQ9CS74 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EcdQ9CS74 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EcdQ9CS74 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EcdQ9CS74 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EcdQ9CS74 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EcdQ9CS74 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EcdQ9CS74 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EcdQ9CS74 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EcdQ9CS74 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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