RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 NTAN1Q96AB6 310 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB17Q9H0T7 212 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 COX16Q9P0S2 106 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 AMACRQ9UHK6 382 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS28Q9UK41 221 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 GJC1P36383 396 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PTGIRP43119 386 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN2P57739 230 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 DAB2P98082 770 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TFDP2Q14188 446 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 FGL2Q14314 439 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM259Q4ZIN3 620 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ALFQ53S48 1182 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CHST14Q8NCH0 376 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF248Q8NDW4 579 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 GRK7Q8WTQ7 553 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 APOLD1Q96LR9 279 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF670Q9BS34 389 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HERPUD2Q9BSE4 406 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ARFGAP3Q9NP61 516 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ASCL3Q9NQ33 180 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SSUH2Q9Y2M2 353 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
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CAPNS1-216ENST00000628306 BNIP3LO60238 219 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 PAGE1O75459 146 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN11O75508 207 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SULT1E1P49888 294 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CLCN6P51797 869 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CFHR1Q03591 330 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CUL1Q13616 776 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CDO1Q16878 200 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SEL1L3Q68CR1 1132 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 SCYL2Q6P3W7 929 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TMCO3Q6UWJ1 677 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF605Q86T29 641 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM181AQ8N9Y4 354 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 TMIEQ8NEW7 156 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 FAF2Q96CS3 445 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 BMFQ96LC9 184 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 LGMNQ99538 433 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 HEMGNQ9BXL5 484 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 CPNE5Q9HCH3 593 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 VPS51Q9UID3 782 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-216ENST00000628306 ERVH48-1M5A8F1 160 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH4P55283 916 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ERP44Q9BS26 406 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM129AQ9BZQ8 928 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SEMA4CQ9C0C4 833 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 NLGN3Q9NZ94 848 aa24.39■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 M0QYT0 321 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 GP1BAP07359 652 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 LSSP48449 732 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CDH6P55285 790 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 GABREP78334 506 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC7A5Q01650 507 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DEUP1Q05D60 604 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 DPYSL3Q14195 570 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SMTNL2Q2TAL5 461 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC27Q6P3X3 843 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 HSPH1Q92598 858 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 IFT43Q96FT9 208 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 RNF157Q96PX1 679 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CALN1Q9BXU9 219 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 EPB41L5Q9HCM4 733 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 FZD10Q9ULW2 581 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SNX10Q9Y5X0 201 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 TRPM6Q9BX84 2022 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 K7ESM1 405 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAMP1O15126 338 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 USP12O75317 370 aa24.37■■□□□ 1.49
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CAPNS1-216ENST00000628306 NEBLO76041 1014 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT10P13645 584 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 IL4RP24394 825 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 AKT2P31751 481 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 L1CAMP32004 1257 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 CXCR3P49682 368 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 GUCY2DQ02846 1103 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB6CQ53S08 254 aa24.37■■□□□ 1.49
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