RNA–Protein interactions for RNA: tC(GCA)B

tC(GCA)B, Transcript of Cysteine tRNA (tRNA-Cys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tC(GCA)B, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tC(GCA)BtC(GCA)B BBC1P47068 1157 aa4.16□□□□□ -1.74
tC(GCA)BtC(GCA)B MET13P53128 600 aa4.16□□□□□ -1.74
tC(GCA)BtC(GCA)B PNG1Q02890 363 aa4.16□□□□□ -1.74
tC(GCA)BtC(GCA)B SLD5Q03406 294 aa4.16□□□□□ -1.74
tC(GCA)BtC(GCA)B MFB1Q04922 465 aa4.16□□□□□ -1.74
tC(GCA)BtC(GCA)B GUD1Q07729 489 aa4.16□□□□□ -1.74
tC(GCA)BtC(GCA)B SGO1Q08490 590 aa4.16□□□□□ -1.74
tC(GCA)BtC(GCA)B BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
tC(GCA)BtC(GCA)B RPP0P05317 312 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SWI6P09959 803 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SYN8P31377 255 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SCT1P32784 759 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B NUP133P36161 1157 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B POA1P38218 177 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B ARP1P38696 384 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B TOM71P38825 639 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B TVP23P38962 199 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B TIF4631P39935 952 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B MPP10P47083 593 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B YNL050CP53952 270 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B PCL8Q08966 492 aa4.15□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B BET2P20133 325 aa4.14□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B YKL097CP34245 136 aa4.14□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SEG2P34250 1132 aa4.14□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B AZR1P50080 613 aa4.14□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B INM2Q05533 292 aa4.14□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B YOL057WQ08225 711 aa4.14□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B PRC1P00729 532 aa4.13□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B ERG12P07277 443 aa4.13□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B DUR3P33413 735 aa4.13□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B GUA1P38625 525 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B NUG1P40010 520 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B CDC19P00549 500 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B MBR1P23493 339 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B PUP3P25451 205 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SHP1P34223 423 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B GPT2P36148 743 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B FLR1P38124 548 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B CST26P38226 397 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B CST6P40535 587 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B NOP2P40991 618 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B POL32P47110 350 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SNU71P53207 620 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR125WP53273 1036 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B YAF9P53930 226 aa4.12□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SAM1P10659 382 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B POL3P15436 1097 aa4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B HCM1P25364 564 aa4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B STB5P38699 743 aa4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B RRP46P53256 223 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B HDA1P53973 706 aa4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SPO71Q03868 1245 aa4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B EAF1Q06337 982 aa4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SNU66Q12420 587 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B MAS2P11914 482 aa4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS29P38759 282 aa4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SET1P38827 1080 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B FUN12P39730 1002 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B MSH4P40965 878 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SPO74P45819 413 aa4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B VPS53P47061 822 aa4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B YMR321CQ04898 105 aa4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B COQ8P27697 501 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B SUV3P32580 737 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B STS1P38637 319 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B GLO3P38682 493 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B OPT1P40897 799 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B YJR008WP47085 338 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B ALD6P54115 500 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B PIG1Q06216 648 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B YDR306CQ06640 478 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B PEX19Q07418 342 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B ERP3Q12403 225 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B TRM11Q12463 433 aa4.09□□□□□ -1.75
tC(GCA)BtC(GCA)B RAD18P10862 487 aa4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B PDR3P33200 976 aa4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B YKR018CP36114 725 aa4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B DBP7P36120 742 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B PTK2P47116 818 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR035CP53222 116 aa4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B YGR122WP53272 402 aa4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B CAF120P53836 1060 aa4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B MTC5Q03897 1148 aa4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B HCR1Q05775 265 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B TRA1P38811 3744 aa4.08□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B MPH3P0CE00 602 aa4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B MCM4P30665 933 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B SWC3P31376 625 aa4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B ALD5P40047 520 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B FAA4P47912 694 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B PIP2P52960 996 aa4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B YML053CQ04978 212 aa4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B DUS3Q06053 668 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B ATG11Q12527 1178 aa4.07□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B LAM4P38800 1345 aa4.06□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B MRP7P12687 371 aa4.06□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B MSD1P15179 658 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
tC(GCA)BtC(GCA)B TFC4P33339 1025 aa4.06□□□□□ -1.76
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